TNNC1

TNNC1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1AP4, 1IH0, 1J1D, 1J1E, 1LXF, 1MXL, 1OZS, 1SPY, 1WRK, 1WRL, 2JT0, 2JT3, 2JT8, 2JTZ, 2JXL, 2KDH, 2KFX, 2KGB, 2KRD, 2L1R, 2L98, 2MKP, 2MLE, 2MLF, 2MZP, 3RV5, 3SD6, 3SWB, 4GJE, 4GJF, 4GJG, 2N79, 4Y99

Ідентифікатори
Символи TNNC1, CMD1Z, CMH13, TN-C, TNC, TNNC, Troponin C type 1, troponin C1, slow skeletal and cardiac type
Зовнішні ІД OMIM: 191040 MGI: 98779 HomoloGene: 55728 GeneCards: TNNC1
Пов'язані генетичні захворювання
dilated cardiomyopathy 1Z, hypertrophic cardiomyopathy 13[1]
Реагує на сполуку
Левосимендан[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

calcium ion binding
protein homodimerization activity
troponin T binding
зв'язування з іоном металу
calcium-dependent protein binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
troponin I binding
actin filament binding

Клітинна компонента

гіалоплазма
Тропонін
contractile fiber
cardiac Troponin complex

Біологічний процес

regulation of muscle contraction
transition between fast and slow fiber
diaphragm contraction
response to metal ion
ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis
muscle filament sliding
regulation of muscle filament sliding speed
regulation of ATP-dependent activity
skeletal muscle contraction
cardiac muscle contraction

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7134
21924
Ensembl
ENSG00000114854
ENSMUSG00000091898
UniProt
P63316
P19123
RefSeq (мРНК)
NM_003280
NM_009393
RefSeq (білок)
NP_003271
NP_033419
Локус (UCSC) Хр. 3: 52.45 – 52.45 Mb Хр. 14: 30.93 – 30.93 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TNNC1 (англ. Troponin C1, slow skeletal and cardiac type) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 161 амінокислот, а молекулярна маса — 18 403[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDDIYKAAVEQLTEEQKNEFKAAFDIFVLGAEDGCISTKELGKVMRMLGQ
NPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVMMVRCMKDDSKGKSEEELSDL
FRMFDKNADGYIDLDELKIMLQATGETITEDDIEELMKDGDKNNDGRIDY
DEFLEFMKGVE

Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

  • Roher A., Lieska N., Spitz W. (1986). The amino acid sequence of human cardiac troponin-C. Muscle Nerve. 9: 73—77. PMID 3951483 DOI:10.1002/mus.880090112
  • Gahlmann R., Wade R., Gunning R., Kedes L. (1988). Differential expression of slow and fast skeletal muscle troponin C. Slow skeletal muscle troponin C is expressed in human fibroblasts. J. Mol. Biol. 201: 379—391. PMID 3166492 DOI:10.1016/0022-2836(88)90145-3
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Takeda S., Kobayashi T., Taniguchi H., Hayashi H., Maeda Y. (1997). Structural and functional domains of the troponin complex revealed by limited digestion. Eur. J. Biochem. 246: 611—617. PMID 9219516 DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.00611.x
  • Lindhout D.A., Sykes B.D. (2003). Structure and dynamics of the C-domain of human cardiac troponin C in complex with the inhibitory region of human cardiac troponin I. J. Biol. Chem. 278: 27024—27034. PMID 12732641 DOI:10.1074/jbc.M302497200
  • Hoffmann B., Schmidt-Traub H., Perrot A., Osterziel K.J., Gessner R. (2001). First mutation in cardiac troponin C, L29Q, in a patient with hypertrophic cardiomyopathy. Hum. Mutat. 17: 524—524. PMID 11385718 DOI:10.1002/humu.1143

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TNNC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Troponin C1, slow skeletal and cardiac type переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11943 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  6. UniProt, P63316 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські