ACTA1

ACTA1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1T44

Ідентифікатори
Символи ACTA1, ACTA, ASMA, CFTD, CFTD1, CFTDM, MPFD, NEM1, NEM2, NEM3, Actin, alpha 1, SHPM, actin, alpha 1, skeletal muscle, actin alpha 1, skeletal muscle
Зовнішні ІД OMIM: 102610 MGI: 87902 HomoloGene: 121702 GeneCards: ACTA1
Пов'язані генетичні захворювання
congenital myopathy with excess of thin filaments[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

nucleotide binding
myosin binding
ADP binding
structural constituent of cytoskeleton
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
ATP binding

Клітинна компонента

цитоплазма
cell body
гіалоплазма
blood microparticle
Філоподія
саркомера
striated muscle thin filament
stress fiber
extracellular fluid
мікрофіламент
actin cytoskeleton
екзосома
цитоскелет
lamellipodium

Біологічний процес

м'язове скорочення
response to steroid hormone
skeletal muscle fiber adaptation
response to mechanical stimulus
skeletal muscle thin filament assembly
response to lithium ion
cell growth
GO:1901313 positive regulation of gene expression
muscle filament sliding
mesenchyme migration
response to extracellular stimulus
skeletal muscle fiber development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
58
11459
Ensembl
ENSG00000143632
ENSMUSG00000031972
UniProt
P68133
P68134
RefSeq (мРНК)
NM_001100
NM_001272041
NM_009606
RefSeq (білок)
NP_001091
NP_001258970
NP_033736
Локус (UCSC) Хр. 1: 229.43 – 229.43 Mb Хр. 8: 124.62 – 124.62 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ACTA1 (англ. Actin, alpha 1, skeletal muscle) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 377 амінокислот, а молекулярна маса — 42 051[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMG
QKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAP
EEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRT
TGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGY
SFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVI
TIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNV
MSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILAS
LSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF

Кодований геном білок за функцією належить до м'язових білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

  • Taylor A., Erba H.P., Muscat G.E.O., Kedes L. (1988). Nucleotide sequence and expression of the human skeletal alpha-actin gene: evolution of functional regulatory domains. Genomics. 3: 323—336. PMID 2907503 DOI:10.1016/0888-7543(88)90123-1
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bosch-Comas A., Lindsten K., Gonzalez-Duarte R., Masucci M.G., Marfany G. (2006). The ubiquitin-specific protease USP25 interacts with three sarcomeric proteins. Cell. Mol. Life Sci. 63: 723—734. PMID 16501887 DOI:10.1007/s00018-005-5533-1
  • Ohlsson M., Tajsharghi H., Darin N., Kyllerman M., Oldfors A. (2004). Follow-up of nemaline myopathy in two patients with novel mutations in the skeletal muscle alpha-actin gene (ACTA1). Neuromuscul. Disord. 14: 471—475. PMID 15336687 DOI:10.1016/j.nmd.2004.05.016
  • Hutchinson D.O., Charlton A., Laing N.G., Ilkovski B., North K.N. (2006). Autosomal dominant nemaline myopathy with intranuclear rods due to mutation of the skeletal muscle ACTA1 gene: clinical and pathological variability within a kindred. Neuromuscul. Disord. 16: 113—121. PMID 16427282 DOI:10.1016/j.nmd.2005.11.004

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ACTA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:129 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  5. UniProt, P68133 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські