DCTN1

DCTN1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1TXQ, 2COY, 2HKN, 2HKQ, 2HL3, 2HL5, 2HQH, 3E2U, 3TQ7

Ідентифікатори
Символи DCTN1, DAP-150, DP-150, P135, dynactin subunit 1
Зовнішні ІД OMIM: 601143 MGI: 107745 HomoloGene: 3011 GeneCards: DCTN1
Пов'язані генетичні захворювання
Perry syndrome, familial amyotrophic lateral sclerosis, sporadic amyotrophic lateral sclerosis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
cytoskeletal motor activity
microtubule binding
tubulin binding
dynein complex binding
protein kinase binding
tau protein binding

Клітинна компонента

цитоплазма
центросома
мембрана
dynactin complex
retromer complex
cell leading edge
dynein complex
мікротрубочка
цитоскелет
кінетохор
центр організації мікротрубочок
клітинне ядро
nuclear envelope
Центріоль
веретено поділу
гіалоплазма
actin cytoskeleton
microtubule plus-end
spindle pole
cell cortex region
cell cortex
microtubule associated complex
аксон
neuron projection
neuronal cell body
intermediate filament cytoskeleton
centriolar subdistal appendage

Біологічний процес

antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
нейробіологія розвитку
endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport
transport along microtubule
IRE1-mediated unfolded protein response
retrograde transport, endosome to Golgi
G2/M transition of mitotic cell cycle
melanosome transport
centriole-centriole cohesion
positive regulation of microtubule polymerization
microtubule anchoring at centrosome
nuclear membrane disassembly
positive regulation of microtubule nucleation
ciliary basal body-plasma membrane docking
non-motile cilium assembly
GO:0007067 мітоз
establishment of mitotic spindle orientation
regulation of mitotic spindle organization
клітинний цикл
поділ клітини
regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle
GO:0015915 транспорт
neuromuscular junction development
ventral spinal cord development
neuromuscular process
motor behavior
neuron cellular homeostasis
Аксоплазматичний транспорт
maintenance of synapse structure
positive regulation of neuromuscular junction development
neuron projection maintenance

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1639
13191
Ensembl
ENSG00000204843
ENSMUSG00000031865
UniProt
Q14203
O08788
RefSeq (мРНК)
NM_001135040
NM_001135041
NM_001190836
NM_001190837
NM_004082
NM_023019
NM_001378991
NM_001378992
NM_001198866
NM_001198867
NM_007835
NM_001347310
RefSeq (білок)
NP_001128512
NP_001128513
NP_001177765
NP_001177766
NP_004073
NP_075408
NP_001365920
NP_001365921
NP_001185795
NP_001185796
NP_001334239
NP_031861
Локус (UCSC) Хр. 2: 74.36 – 74.39 Mb Хр. 6: 83.14 – 83.18 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DCTN1 (англ. Dynactin subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 278 амінокислот, а молекулярна маса — 141 695[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGAT
LFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDG
ADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSKLRGLKPKKAPTARKTTTRRP
KPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPV
LTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEK
HKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADT
ADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG
SDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQ
ELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNL
EEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQ
KRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPP
ETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPG
GDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQL
SFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLD
FLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHI
KFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKK
IRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQ
LIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTM
NKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRET
VIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEE
TQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRG
PPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAM
RLHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYR
KTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVE
KLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTF
SCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

  • Collin G.B., Nishina P.M., Marshall J.D., Naggert J.K. (1998). Human DCTN1: genomic structure and evaluation as a candidate for Alstrom syndrome. Genomics. 53: 359—364. PMID 9799602 DOI:10.1006/geno.1998.5542
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Holzbaur E.L.F., Tokito M.K. (1996). Localization of the DCTN1 gene encoding p150Glued to human chromosome 2p13 by fluorescence in situ hybridization. Genomics. 31: 398—399. PMID 8838327 DOI:10.1006/geno.1996.0068
  • Tokito M.K., Howland D.S., Lee V.M.-Y., Holzbaur E.L.F. (1996). Functionally distinct isoforms of dynactin are expressed in human neurons. Mol. Biol. Cell. 7: 1167—1180. PMID 8856662 DOI:10.1091/mbc.7.8.1167
  • Tokito M.K., Holzbaur E.L.F. (1998). The genomic structure of DCTN1, a candidate gene for limb-girdle muscular dystrophy. Biochim. Biophys. Acta. 1442: 432—436. PMID 9805007 DOI:10.1016/S0167-4781(98)00195-X
  • Bu W., Su L.-K. (2003). Characterization of functional domains of human EB1 family proteins. J. Biol. Chem. 278: 49721—49731. PMID 14514668 DOI:10.1074/jbc.M306194200

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з DCTN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2711 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  5. UniProt, Q14203 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.