ECM1

ECM1
Ідентифікатори
Символи ECM1, URBWD, extracellular matrix protein 1
Зовнішні ІД OMIM: 602201 MGI: 103060 HomoloGene: 3260 GeneCards: ECM1
Пов'язані генетичні захворювання
Хвороба Урбаха — Віте[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• interleukin-2 receptor binding
• signal transducer activity
• protease binding
• protein C-terminus binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• enzyme binding
• laminin binding

Клітинна компонента

• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• екзосома
• extracellular region
• platelet dense granule lumen
• міжклітинний простір

Біологічний процес

• regulation of T cell migration
• negative regulation of peptidase activity
• negative regulation of bone mineralization
• positive regulation of endothelial cell proliferation
• осифікація
• regulation of bone mineralization
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
• biomineral tissue development
• negative regulation of cytokine-mediated signaling pathway
• positive regulation of angiogenesis
• Ангіогенез
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• inflammatory response
• regulation of type 2 immune response
• platelet degranulation
• GO:0072468 сигнальна трансдукція

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1893
13601
Ensembl
ENSG00000143369
ENSMUSG00000028108
UniProt
Q16610
Q61508
RefSeq (мРНК)
NM_022664
NM_001202858
NM_004425
NM_001252653
NM_007899
NM_001355070
RefSeq (білок)
NP_001189787
NP_004416
NP_073155
NP_001239582
NP_031925
NP_001341999
Локус (UCSC) Хр. 1: 150.51 – 150.51 Mb Хр. 3: 95.64 – 95.65 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ECM1 (англ. Extracellular matrix protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 60 674[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGTTARAALVLTYLAVASAASEGGFTATGQRQLRPEHFQEVGYAAPPSPP
LSRSLPMDHPDSSQHGPPFEGQSQVQPPPSQEATPLQQEKLLPAQLPAEK
EVGPPLPQEAVPLQKELPSLQHPNEQKEGTPAPFGDQSHPEPESWNAAQH
CQQDRSQGGWGHRLDGFPPGRPSPDNLNQICLPNRQHVVYGPWNLPQSSY
SHLTRQGETLNFLEIGYSRCCHCRSHTNRLECAKLVWEEAMSRFCEAEFS
VKTRPHWCCTRQGEARFSCFQEEAPQPHYQLRACPSHQPDISSGLELPFP
PGVPTLDNIKNICHLRRFRSVPRNLPATDPLQRELLALIQLEREFQRCCR
QGNNHTCTWKAWEDTLDKYCDREYAVKTHHHLCCRHPPSPTRDECFARRA
PYPNYDRDILTIDIGRVTPNLMGHLCGNQRVLTKHKHIPGLIHNMTARCC
DLPFPEQACCAEEEKLTFINDLCGPRRNIWRDPALCCYLSPGDEQVNCFN
INYLRNVALVSGDTENAKGQGEQGSTGGTNISSTSEPKEE

Задіяний у таких біологічних процесах як ангіогенез, остеогенез, мінеральний обмін, поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ECM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3153 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q16610 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Позаклітинний матрикс
Колаген
Фібрилотворчі
Інші
  • мультиплексин: COL15A1
  • тип XVIII
Ензими
Ламінін
Інші
Інші