COL25A1

Ідентифікатори

Символи

COL25A1, AMY, CLAC, CLAC-P, CLACP, CFEOM5, Collagen, type XXV, alpha 1, collagen type XXV alpha 1, collagen type XXV alpha 1 chain

Зовнішні ІД

OMIM: 610004 MGI: 1924268 HomoloGene: 57111 GeneCards: COL25A1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding • amyloid-beta binding • extracellular matrix structural constituent • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength
Клітинна компонента	• integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • колаген • endoplasmic reticulum lumen • мембрана • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• axonogenesis involved in innervation • extracellular matrix organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84570


77018

Ensembl


ENSG00000188517


ENSMUSG00000058897

UniProt


Q9BXS0


Q99MQ5

RefSeq (мРНК)


NM_001256074 NM_032518 NM_198721


NM_001244952 NM_029838 NM_198711

RefSeq (білок)


NP_001243003 NP_115907 NP_942014


NP_001231881 NP_084114 NP_942004

Локус (UCSC)

Хр. 4: 108.81 – 109.3 Mb

Хр. 3: 129.93 – 130.39 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

COL25A1 (англ. Collagen type XXV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 654 амінокислот, а молекулярна маса — 64 771^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLKKHAGKG	GGREPRSEDP	TPAEQHCART	MPPCAVLAAL	LSVVAVVSCL
YLGVKTNDLQ	ARIAALESAK	GAPSIHLLPD	TLDHLKTMVQ	EKVERLLAQK
SYEHMAKIRI	AREAPSECNC	PAGPPGKRGK	RGRRGESGPP	GQPGPQGPPG
PKGDKGEQGD	QGPRMVFPKI	NHGFLSADQQ	LIKRRLIKGD	QGQAGPPGPP
GPPGPRGPPG	DTGKDGPRGM	PGVPGEPGKP	GEQGLMGPLG	PPGQKGSIGA
PGIPGMNGQK	GEPGLPGAVG	QNGIPGPKGE	PGEQGEKGDA	GENGPKGDTG
EKGDPGSSAA	GIKGEPGESG	RPGQKGEPGL	PGLPGLPGIK	GEPGFIGPQG
EPGLPGLPGT	KGERGEAGPP	GRGERGEPGA	PGPKGKQGES	GTRGPKGSKG
DRGEKGDSGA	QGPRGPPGQK	GDQGATEIID	YNGNLHEALQ	RITTLTVTGP
PGPPGPQGLQ	GPKGEQGSPG	IPGMDGEQGL	KGSKGDMGDP	GMTGEKGGIG
LPGLPGANGM	KGEKGDSGMP	GPQGPSIIGP	PGPPGPHGPP	GPMGPHGLPG
PKGTDGPMGP	HGPAGPKGER	GEKGAMGEPG	PRGPYGLPGK	DGEPGLDGFP
GPRGEKGDLG	EKGEKGFRGV	KGEKGEPGQP	GLDGLDAPCQ	LGPDGLPMPG
CWQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Локалізований у мембрані.

Література

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18603 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BXS0 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фібрилярні білки

Позаклітинний матрикс

Колаген

Фібрилотворчі	тип І COL1A1 COL1A2 тип ІІ (COL2A1) тип ІІІ COL3A1 тип V COL5A1 COL5A2 COL5A3 COL24A1 COL26A1

Інші	FACIT: тип IX COL9A1 COL9A2 COL9A3 тип XII (COL12A1) COL14A1 COL16A1 COL19A1 COL20A1 COL21A1 COL22A1 базальна мембрана: тип IV COL4A1 COL4A2 COL4A3 COL4A4 COL4A5 COL4A6 мультиплексин: COL15A1 тип XVIII COL18A1 Ендостатин трансмембрана: COL13A1 COL17A1 COL23A1 COL25A1 інші: тип VI COL6A1 COL6A2 COL6A3 COL6A5 тип VII COL7A1 тип VIII COL8A1 COL8A2 тип X (COL10A1) тип XI COL11A1 COL11A2 COL27A1 COL28A1

Ензими	Пролілгідроксилаза/Лізилгідроксилаза CRTAP/Лепрекан ADAMTS2 Проколаген пептидаза Лізилоксидаза