COL24A1

COL24A1
Ідентифікатори
Символи COL24A1, collagen, type XXIV, alpha 1
Зовнішні ІД OMIM: 610025 MGI: 1918605 HomoloGene: 65061 GeneCards: COL24A1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• extracellular matrix structural constituent
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength

Клітинна компонента

• extracellular region
• колаген
• endoplasmic reticulum lumen
• міжклітинний простір
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• hematopoietic progenitor cell differentiation
• extracellular matrix organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
255631
71355
Ensembl
ENSG00000171502
ENSMUSG00000028197
UniProt
Q17RW2
Q30D77
RefSeq (мРНК)
NM_152890
NM_027770
NM_001317733
RefSeq (білок)
NP_690850
NP_001336884
NP_001304662
NP_082046
Локус (UCSC) н/д Хр. 3: 145 – 145.26 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL24A1 (англ. Collagen type XXIV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 714 амінокислот, а молекулярна маса — 175 496[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHLRAHRTRRGKVSPTAKTKSLLHFIVLCVAGVVVHAQEQGIDILHQLGL
GGKDVRHSSPATAVPSASTPLPQGVHLTESGVIFKNDAYIETPFVKILPV
NLGQPFTILTGLQSHRVNNAFLFSIRNKNRLQLGVQLLPKKLVVHIRGKQ
PAVFNYSVHDEQWHSFAITIRNQSVSMFVECGKKYFSTETIPEVQTFDSN
SVFTLGSMNNNSIHFEGIVCQLDIIPSAEASADYCRYVKQQCRQADKYQP
ETSIPCTTLIPTKIPEHSPPPKLFAEKVLSEDTFTEGKSIPNIIKNDSET
VYKRQEHQISRSQLSSLQSGNVSAVDLTNHGIQAKEMITEEDTQTNFSLS
VTTHRISEAKMNTKEKFSSLLNMSDNITQHDDRVTGLSLFKKMPSILPQI
KQDTITNLKKAITANLHTNELMEMQPILNTSLHRVTNEPSVDNHLDLRKE
GEFYPDATYPIENSYETELYDYYYYEDLNTMLEMEYLRGPKGDTGPPGPP
GPAGIPGPSGKRGPRGIPGPHGNPGLPGLPGPKGPKGDPGFSPGQPVPGE
KGDQGLSGLMGPPGMQGDKGLKGHPGLPGLPGEQGIPGFAGNIGSPGYPG
RQGLAGPEGNPGPKGAQGFIGSPGEAGQLGPEGERGIPGIRGKKGFKGRQ
GFPGDFGDRGPAGLDGSPGLVGGTGPPGFPGLRGSVGPVGPIGPAGIPGP
MGLSGNKGLPGIKGDKGEQGTAGELGEPGYPGDKGAVGLPGPPGMRGKSG
PSGQTGDPGLQGPSGPPGPEGFPGDIGIPGQNGPEGPKGLLGNRGPPGPP
GLKGTQGEEGPIGAFGELGPRGKPGQKGYAGEPGPEGLKGEVGDQGNIGK
IGETGPVGLPGEVGMTGSIGEKGERGSPGPLGPQGEKGVMGYPGPPGVPG
PIGPLGLPGHVGARGPPGSQGPKGQRGSRGPDGLLGEQGIQGAKGEKGDQ
GKRGPHGLIGKTGNPGERGFQGKPGLQGLPGSTGDRGLPGEPGLRGLQGD
VGPPGEMGMEGPPGTEGESGLQGEPGAKGDVGTAGSVGGTGEPGLRGEPG
APGEEGLQGKDGLKGVPGGRGLPGEDGEKGEMGLPGIIGPLGRSGQTGLP
GPEGIVGIPGQRGRPGKKGDKGQIGPTGEVGSRGPPGKIGKSGPKGARGT
RGAVGHLGLMGPDGEPGIPGYRGHQGQPGPSGLPGPKGEKGYPGEDSTVL
GPPGPRGEPGPVGDQGERGEPGAEGYKGHVGVPGLRGATGQQGPPGEPGD
QGEQGLKGERGSEGNKGKKGAPGPSGKPGIPGLQGLLGPKGIQGYHGADG
ISGNPGKIGPPGKQGLPGIRGGPGRTGLAGAPGPPGVKGSSGLPGSPGIQ
GPKGEQGLPGQPGIQGKRGHRGAQGDQGPCGDPGLKGQPGEYGVQGLTGF
QGFPGPKGPEGDAGIVGISGPKGPIGHRGNTGPLGREGIIGPTGRTGPRG
EKGFRGETGPQGPRGQPGPPGPPGAPGPRKQMDINAAIQALIESNTALQM
ESYQNTEVTLIDHSEEIFKTLNYLSNLLHSIKNPLGTRDNPARICKDLLN
CEQKVSDGKYWIDPNLGCPSDAIEVFCNFSAGGQTCLPPVSVTKLEFGVG
KVQMNFLHLLSSEATHIITIHCLNTPRWTSTQTSGPGLPIGFKGWNGQIF
KVNTLLEPKVLSDDCKIQDGSWHKATFLFHTQEPNQLPVIEVQKLPHLKT
ERKYYIDSSSVCFL

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20821 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 25 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q17RW2 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Позаклітинний матрикс
Колаген
Фібрилотворчі
Інші
  • мультиплексин: COL15A1
  • тип XVIII
Ензими
Ламінін
Інші
Інші