CXCR4

CXCR4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4RWS, 2K03, 2K04, 2K05, 3ODU, 3OE0, 3OE6, 3OE8, 3OE9, 2N55

Ідентифікатори
Символи CXCR4, CD184, D2S201E, FB22, HM89, HSY3RR, LAP-3, LAP3, LCR1, LESTR, NPY3R, NPYR, NPYRL, NPYY3R, WHIM, WHIMS, C-X-C motif chemokine receptor 4, WHIMS1
Зовнішні ІД OMIM: 162643 MGI: 109563 HomoloGene: 20739 GeneCards: CXCR4
Пов'язані генетичні захворювання
WHIM syndrome[1]
Реагує на сполуку
plerixafor, mavorixafor[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0019974 cytokine binding
• coreceptor activity
• virus receptor activity
• signal transducer activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• chemokine receptor activity
• myosin light chain binding
• actin binding
• ubiquitin protein ligase binding
• G protein-coupled receptor activity
• C-X-C chemokine receptor activity
• ubiquitin binding
• C-C chemokine binding
• C-C chemokine receptor activity
• chemokine binding
• C-X-C motif chemokine 12 receptor activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• ендосома
• мембрана
• cell surface
• міжклітинні контакти
• cell leading edge
• екзосома
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• early endosome
• late endosome
• лізосома
• клітинна мембрана
• external side of plasma membrane
• GO:0009327 protein-containing complex
• клітинне ядро

Біологічний процес

• myelin maintenance
• positive regulation of oligodendrocyte differentiation
• response to hypoxia
• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
• chemokine-mediated signaling pathway
• response to virus
• dendritic cell chemotaxis
• cellular response to cytokine stimulus
• хемотаксис
• inflammatory response
• calcium-mediated signaling
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• GO:0097285 апоптоз
• GO:0022415 viral process
• fusion of virus membrane with host plasma membrane
• regulation of chemotaxis
• G protein-coupled receptor signaling pathway
• axon guidance
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• brain development
• Нейрогенез
• CXCL12-activated CXCR4 signaling pathway
• cell chemotaxis
• positive regulation of cold-induced thermogenesis
• regulation of cell adhesion
• neuron migration
• epithelial cell development
• neuron recognition
• response to activity
• cell migration
• telencephalon cell migration
• positive regulation of cell migration
• positive regulation of vascular wound healing
• regulation of programmed cell death
• response to morphine
• endothelial cell differentiation
• positive regulation of neurogenesis
• regulation of viral process
• positive regulation of chemotaxis
• detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain
• detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain
• regulation of calcium ion transport
• cardiac muscle contraction
• endothelial tube morphogenesis
• positive regulation of dendrite extension
• positive regulation of mesenchymal stem cell migration
• response to ultrasound

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7852
12767
Ensembl
ENSG00000121966
ENSMUSG00000045382
UniProt
P61073
P70658
RefSeq (мРНК)
NM_003467
NM_001008540
NM_001348056
NM_001348059
NM_001348060
NM_009911
NM_001356509
RefSeq (білок)
NP_001008540
NP_003458
NP_001334985
NP_001334988
NP_001334989
NP_034041
NP_001343438
Локус (UCSC) Хр. 2: 136.11 – 136.12 Mb Хр. 1: 128.52 – 128.52 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CXCR4 (англ. C-X-C motif chemokine receptor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 39 746[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEGISIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPCFREENANFNKIFLPTIYSIIFL
TGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVA
NWYFGNFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKL
LAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSEADDRYICDRFYPNDLWVVVFQ
FQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTVILILAFFA
CWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPI
LYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSFH
SS

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, лізосомі, ендосомах.

Література

  • Herzog H., Hort Y.J., Shine J., Selbie L.A. (1993). Molecular cloning, characterization, and localization of the human homolog to the reported bovine NPY Y3 receptor: lack of NPY binding and activation. DNA Cell Biol. 12: 465—471. PMID 8329116 DOI:10.1089/dna.1993.12.465
  • Nomura H., Nielsen B.W., Matsushima K. (1993). Molecular cloning of cDNAs encoding a LD78 receptor and putative leukocyte chemotactic peptide receptors. Int. Immunol. 5: 1239—1249. PMID 7505609 DOI:10.1093/intimm/5.10.1239
  • Feng Y., Broder C.C., Kennedy P.E., Berger E.A. (1996). HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven-transmembrane, G protein-coupled receptor. Science. 272: 872—877. PMID 8629022 DOI:10.1126/science.272.5263.872
  • Frodl R., Gierschik P., Moepps B. (1998). Genomic organization and expression of the CXCR4 gene in mouse and man: absence of a splice variant corresponding to mouse CXCR4-B in human tissues. J. Recept. Signal Transduct. 18: 321—344. PMID 9879064 DOI:10.3109/10799899809047750
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Brelot A., Heveker N., Montes M., Alizon M. (2000). Identification of residues of CXCR4 critical for human immunodeficiency virus coreceptor and chemokine receptor activities. J. Biol. Chem. 275: 23736—23744. PMID 10825158 DOI:10.1074/jbc.M000776200

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2561 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  6. ↑ UniProt, P61073 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350