CD40

CD40
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1CZZ, 1D00, 1FLL, 1LB6, 3QD6, 5DMJ, 5IHL, 5DMI

Ідентифікатори
Символи CD40, Bp50, CDW40, TNFRSF5, p50, CD40 (protein), CD40 molecule
Зовнішні ІД OMIM: 109535 MGI: 88336 HomoloGene: 954 GeneCards: CD40
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, CD40 deficiency[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0003823, GO:0051635 antigen binding
• signal transducer activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• tumor necrosis factor-activated receptor activity
• enzyme binding
• ubiquitin protein ligase binding
• protein domain specific binding
• signaling receptor activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• мембрана
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• extracellular region
• cell surface
• CD40 receptor complex
• екзосома
• external side of plasma membrane
• міжклітинний простір
• neuronal cell body
• varicosity

Біологічний процес

• positive regulation of protein phosphorylation
• positive regulation of MAP kinase activity
• positive regulation of interleukin-12 production
• protein kinase B signaling
• positive regulation of protein kinase C signaling
• процес імунної системи
• cellular calcium ion homeostasis
• tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
• immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway
• platelet activation
• multicellular organism development
• B cell activation
• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
• response to lipopolysaccharide
• B cell proliferation
• cellular response to mechanical stimulus
• positive regulation of endothelial cell apoptotic process
• regulation of cell population proliferation
• positive regulation of B cell proliferation
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• defense response to virus
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• regulation of immune response
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• apoptotic signaling pathway
• positive regulation of isotype switching to IgG isotypes
• cellular response to lipopolysaccharide
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• defense response to protozoan
• response to bacterium
• response to nutrient levels
• response to cobalamin
• response to interferon-gamma
• cellular response to erythropoietin
• cellular response to interleukin-1
• cellular response to tumor necrosis factor
• response to peptide
• inflammatory response
• positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein
• positive regulation of blood vessel endothelial cell migration
• positive regulation of angiogenesis
• GO:0034622 protein-containing complex assembly

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
958
21939
Ensembl
ENSG00000101017
ENSMUSG00000017652
UniProt
P25942
P27512
RefSeq (мРНК)
NM_001250
NM_001302753
NM_152854
NM_001322421
NM_001322422
NM_001362758
NM_011611
NM_170702
NM_170703
NM_170704
RefSeq (білок)
NP_001241
NP_001289682
NP_001309350
NP_001309351
NP_690593
NP_001349687
NP_035741
NP_733803
NP_733804
NP_733805
Локус (UCSC) Хр. 20: 46.12 – 46.13 Mb Хр. 2: 164.9 – 164.91 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CD40 (англ. CD40 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 30 619[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVRLPLQCVLWGCLLTAVHPEPPTACREKQYLINSQCCSLCQPGQKLVSD
CTEFTETECLPCGESEFLDTWNRETHCHQHKYCDPNLGLRVQQKGTSETD
TICTCEEGWHCTSEACESCVLHRSCSPGFGVKQIATGVSDTICEPCPVGF
FSNVSSAFEKCHPWTSCETKDLVVQQAGTNKTDVVCGPQDRLRALVVIPI
IFGILFAILLVLVFIKKVAKKPTNKAPHPKQEPQEINFPDDLPGSNTAAP
VQETLHGCQPVTQEDGKESRISVQERQ

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • Tone M., Tone Y., Fairchild P.J., Wykes M., Waldmann H. (2001). Regulation of CD40 function by its isoforms generated through alternative splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1751—1756. PMID 11172023 DOI:10.1073/pnas.98.4.1751
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
  • Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995). A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40. FEBS Lett. 358: 113—118. PMID 7530216 DOI:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
  • Bajorath J., Aruffo A. (1997). Construction and analysis of a detailed three-dimensional model of the ligand binding domain of the human B cell receptor CD40. Proteins. 27: 59—70. PMID 9037712 DOI:10.1002/(SICI)1097-0134(199701)27:1<59::AID-PROT7>3.3.CO;2-Z
  • Stamenkovic I., Clark E.A., Seed B. (1989). A B-lymphocyte activation molecule related to the nerve growth factor receptor and induced by cytokines in carcinomas. EMBO J. 8: 1403—1410. PMID 2475341

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CD40 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11919 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P25942 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350