TRPC5

Ідентифікатори

Символи

TRPC5, PPP1R159, TRP5, transient receptor potential cation channel subfamily C member 5

Зовнішні ІД

OMIM: 300334 MGI: 109524 HomoloGene: 74915 GeneCards: TRPC5

Реагує на сполуку

Розиглітазон, Дайджеїн, Геністейн, 2-aminoethoxydiphenylborate, Прогестерон, хлорпромазин, flufenamic acid^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • store-operated calcium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity • clathrin binding • actin binding • actinin binding • ATPase binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • Кальцієві канали • мембрана • цитоплазма • growth cone • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • membrane raft • cation channel complex
Біологічний процес	• manganese ion transport • ion transport • regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium ion transmembrane transport • calcium ion transport • нейробіологія розвитку • regulation of membrane hyperpolarization • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • positive regulation of axon extension • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • neuron differentiation • positive regulation of neuron differentiation • negative regulation of dendrite morphogenesis • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7224


22067

Ensembl


ENSG00000072315


ENSMUSG00000041710

UniProt


Q9UL62


Q9QX29

RefSeq (мРНК)


NM_012471


NM_009428

RefSeq (білок)


NP_036603


NP_033454

Локус (UCSC)

Хр. X: 111.77 – 112.08 Mb

Хр. X: 143.16 – 143.47 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPC5 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 111 412^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQLYYKKVN	YSPYRDRIPL	QIVRAETELS	AEEKAFLNAV	EKGDYATVKQ
ALQEAEIYYN	VNINCMDPLG	RSALLIAIEN	ENLEIMELLL	NHSVYVGDAL
LYAIRKEVVG	AVELLLSYRR	PSGEKQVPTL	MMDTQFSEFT	PDITPIMLAA
HTNNYEIIKL	LVQKRVTIPR	PHQIRCNCVE	CVSSSEVDSL	RHSRSRLNIY
KALASPSLIA	LSSEDPILTA	FRLGWELKEL	SKVENEFKAE	YEELSQQCKL
FAKDLLDQAR	SSRELEIILN	HRDDHSEELD	PQKYHDLAKL	KVAIKYHQKE
FVAQPNCQQL	LATLWYDGFP	GWRRKHWVVK	LLTCMTIGFL	FPMLSIAYLI
SPRSNLGLFI	KKPFIKFICH	TASYLTFLFM	LLLASQHIVR	TDLHVQGPPP
TVVEWMILPW	VLGFIWGEIK	EMWDGGFTEY	IHDWWNLMDF	AMNSLYLATI
SLKIVAYVKY	NGSRPREEWE	MWHPTLIAEA	LFAISNILSS	LRLISLFTAN
SHLGPLQISL	GRMLLDILKF	LFIYCLVLLA	FANGLNQLYF	YYETRAIDEP
NNCKGIRCEK	QNNAFSTLFE	TLQSLFWSVF	GLLNLYVTNV	KARHEFTEFV
GATMFGTYNV	ISLVVLLNML	IAMMNNSYQL	IADHADIEWK	FARTKLWMSY
FDEGGTLPPP	FNIIPSPKSF	LYLGNWFNNT	FCPKRDPDGR	RRRRNLRSFT
ERNADSLIQN	QHYQEVIRNL	VKRYVAAMIR	NSKTHEGLTE	ENFKELKQDI
SSFRYEVLDL	LGNRKHPRSF	STSSTELSQR	DDNNDGSGGA	RAKSKSVSFN
LGCKKKTCHG	PPLIRTMPRS	SGAQGKSKAE	SSSKRSFMGP	SLKKLGLLFS
KFNGHMSEPS	SEPMYTISDG	IVQQHCMWQD	IRYSQMEKGK	AEACSQSEIN
LSEVELGEVQ	GAAQSSECPL	ACSSSLHCAS	SICSSNSKLL	DSSEDVFETW
GEACDLLMHK	WGDGQEEQVT	TRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12337 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UL62 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані