MMP13
| MMP13 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | MMP13, CLG3, MANDP1, MMP-13, Matrix metallopeptidase 13, MDST | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 600108 MGI: 1340026 HomoloGene: 20548 GeneCards: MMP13 | ||||||||||||||||
| Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
| spondyloepimetaphyseal dysplasia, Missouri type, metaphyseal chondrodysplasia, Spahr type[1] | |||||||||||||||||
| Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
| apratastat, cts-1027[2] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Шаблон експресії | |||||||||||||||||
 | |||||||||||||||||
| Більше даних | |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 11: 102.94 – 102.96 Mb | Хр. 9: 7.27 – 7.28 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | [3] | [4] | |||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
MMP13 (англ. Matrix metallopeptidase 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 471 амінокислот, а молекулярна маса — 53 820[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MHPGVLAAFL | FLSWTHCRAL | PLPSGGDEDD | LSEEDLQFAE | RYLRSYYHPT | ||||
| NLAGILKENA | ASSMTERLRE | MQSFFGLEVT | GKLDDNTLDV | MKKPRCGVPD | ||||
| VGEYNVFPRT | LKWSKMNLTY | RIVNYTPDMT | HSEVEKAFKK | AFKVWSDVTP | ||||
| LNFTRLHDGI | ADIMISFGIK | EHGDFYPFDG | PSGLLAHAFP | PGPNYGGDAH | ||||
| FDDDETWTSS | SKGYNLFLVA | AHEFGHSLGL | DHSKDPGALM | FPIYTYTGKS | ||||
| HFMLPDDDVQ | GIQSLYGPGD | EDPNPKHPKT | PDKCDPSLSL | DAITSLRGET | ||||
| MIFKDRFFWR | LHPQQVDAEL | FLTKSFWPEL | PNRIDAAYEH | PSHDLIFIFR | ||||
| GRKFWALNGY | DILEGYPKKI | SELGLPKEVK | KISAAVHFED | TGKTLLFSGN | ||||
| QVWRYDDTNH | IMDKDYPRLI | EEDFPGIGDK | VDAVYEKNGY | IYFFNGPIQF | ||||
| EYSIWSNRIV | RVMPANSILW | C |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Knaeuper V., Lopez-Otin C., Smith B., Knight G., Murphy G. (1996). Biochemical characterization of human collagenase-3. J. Biol. Chem. 271: 1544—1550. PMID 8576151 DOI:10.1074/jbc.271.3.1544
- Fosang A.J., Last K., Knaeuper V., Murphy G., Neame P.J. (1996). Degradation of cartilage aggrecan by collagenase-3 (MMP-13). FEBS Lett. 380: 17—20. PMID 8603731 DOI:10.1016/0014-5793(95)01539-6
- Li D., Weber D.R., Deardorff M.A., Hakonarson H., Levine M.A. (2015). Exome sequencing reveals a nonsense mutation in MMP13 as a new cause of autosomal recessive metaphyseal anadysplasia. Eur. J. Hum. Genet. 23: 264—266. PMID 24781753 DOI:10.1038/ejhg.2014.76
- Maskos K., Lang R., Tschesche H., Bode W. (2007). Flexibility and variability of TIMP binding: X-ray structure of the complex between collagenase-3/MMP-13 and TIMP-2. J. Mol. Biol. 366: 1222—1231. PMID 17196980 DOI:10.1016/j.jmb.2006.11.072
- Stura E.A., Visse R., Cuniasse P., Dive V., Nagase H. (2013). Crystal structure of full-length human collagenase 3 (MMP-13) with peptides in the active site defines exosites in the catalytic domain. FASEB J. 27: 4395—4405. PMID 23913860 DOI:10.1096/fj.13-233601
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з MMP13 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 13 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7159 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P45452 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 11
 | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
| ||||||||
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
