ADAMTS9 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ADAMTS9, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605421 MGI: 1916320 HomoloGene: 18821 GeneCards: ADAMTS9 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • endopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • ендоплазматичний ретикулум • внутрішньоклітинна мембранна органела • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • protein transport • regulation of developmental pigmentation • vesicle-mediated transport • positive regulation of melanocyte differentiation • протеоліз • glycoprotein catabolic process • heart valve morphogenesis • ventricular cardiac muscle tissue development • negative regulation of endothelial cell migration • extracellular matrix organization • aorta morphogenesis • endothelial cell-matrix adhesion • negative regulation of sprouting angiogenesis • response to bacterium |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c3/PBB_GE_ADAMTS9_220287_at_fs.png/250px-PBB_GE_ADAMTS9_220287_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_182920 NM_001318781 NM_020249 NM_182921 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 64.52 – 64.69 Mb | Хр. 6: 92.75 – 92.92 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ADAMTS9 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 935 амінокислот, а молекулярна маса — 216 491[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQFVSWATLL | | TLLVRDLAEM | | GSPDAAAAVR | | KDRLHPRQVK | | LLETLSEYEI |
VSPIRVNALG | | EPFPTNVHFK | | RTRRSINSAT | | DPWPAFASSS | | SSSTSSQAHY |
RLSAFGQQFL | | FNLTANAGFI | | APLFTVTLLG | | TPGVNQTKFY | | SEEEAELKHC |
FYKGYVNTNS | | EHTAVISLCS | | GMLGTFRSHD | | GDYFIEPLQS | | MDEQEDEEEQ |
NKPHIIYRRS | | APQREPSTGR | | HACDTSEHKN | | RHSKDKKKTR | | ARKWGERINL |
AGDVAALNSG | | LATEAFSAYG | | NKTDNTREKR | | THRRTKRFLS | | YPRFVEVLVV |
ADNRMVSYHG | | ENLQHYILTL | | MSIVASIYKD | | PSIGNLINIV | | IVNLIVIHNE |
QDGPSISFNA | | QTTLKNFCQW | | QHSKNSPGGI | | HHDTAVLLTR | | QDICRAHDKC |
DTLGLAELGT | | ICDPYRSCSI | | SEDSGLSTAF | | TIAHELGHVF | | NMPHDDNNKC |
KEEGVKSPQH | | VMAPTLNFYT | | NPWMWSKCSR | | KYITEFLDTG | | YGECLLNEPE |
SRPYPLPVQL | | PGILYNVNKQ | | CELIFGPGSQ | | VCPYMMQCRR | | LWCNNVNGVH |
KGCRTQHTPW | | ADGTECEPGK | | HCKYGFCVPK | | EMDVPVTDGS | | WGSWSPFGTC |
SRTCGGGIKT | | AIRECNRPEP | | KNGGKYCVGR | | RMKFKSCNTE | | PCLKQKRDFR |
DEQCAHFDGK | | HFNINGLLPN | | VRWVPKYSGI | | LMKDRCKLFC | | RVAGNTAYYQ |
LRDRVIDGTP | | CGQDTNDICV | | QGLCRQAGCD | | HVLNSKARRD | | KCGVCGGDNS |
SCKTVAGTFN | | TVHYGYNTVV | | RIPAGATNID | | VRQHSFSGET | | DDDNYLALSS |
SKGEFLLNGN | | FVVTMAKREI | | RIGNAVVEYS | | GSETAVERIN | | STDRIEQELL |
LQVLSVGKLY | | NPDVRYSFNI | | PIEDKPQQFY | | WNSHGPWQAC | | SKPCQGERKR |
KLVCTRESDQ | | LTVSDQRCDR | | LPQPGHITEP | | CGTDCDLRWH | | VASRSECSAQ |
CGLGYRTLDI | | YCAKYSRLDG | | KTEKVDDGFC | | SSHPKPSNRE | | KCSGECNTGG |
WRYSAWTECS | | KSCDGGTQRR | | RAICVNTRND | | VLDDSKCTHQ | | EKVTIQRCSE |
FPCPQWKSGD | | WSECLVTCGK | | GHKHRQVWCQ | | FGEDRLNDRM | | CDPETKPTSM |
QTCQQPECAS | | WQAGPWGQCS | | VTCGQGYQLR | | AVKCIIGTYM | | SVVDDNDCNA |
ATRPTDTQDC | | ELPSCHPPPA | | APETRRSTYS | | APRTQWRFGS | | WTPCSATCGK |
GTRMRYVSCR | | DENGSVADES | | ACATLPRPVA | | KEECSVTPCG | | QWKALDWSSC |
SVTCGQGRAT | | RQVMCVNYSD | | HVIDRSECDQ | | DYIPETDQDC | | SMSPCPQRTP |
DSGLAQHPFQ | | NEDYRPRSAS | | PSRTHVLGGN | | QWRTGPWGAC | | SSTCAGGSQR |
RVVVCQDENG | | YTANDCVERI | | KPDEQRACES | | GPCPQWAYGN | | WGECTKLCGG |
GIRTRLVVCQ | | RSNGERFPDL | | SCEILDKPPD | | REQCNTHACP | | HDAAWSTGPW |
SSCSVSCGRG | | HKQRNVYCMA | | KDGSHLESDY | | CKHLAKPHGH | | RKCRGGRCPK |
WKAGAWSQCS | | VSCGRGVQQR | | HVGCQIGTHK | | IARETECNPY | | TRPESERDCQ |
GPRCPLYTWR | | AEEWQECTKT | | CGEGSRYRKV | | VCVDDNKNEV | | HGARCDVSKR |
PVDRESCSLQ | | PCEYVWITGE | | WSECSVTCGK | | GYKQRLVSCS | | EIYTGKENYE |
YSYQTTINCP | | GTQPPSVHPC | | YLRDCPVSAT | | WRVGNWGSCS | | VSCGVGVMQR |
SVQCLTNEDQ | | PSHLCHTDLK | | PEERKTCRNV | | YNCELPQNCK | | EVKRLKGASE |
DGEYFLMIRG | | KLLKIFCAGM | | HSDHPKEYVT | | LVHGDSENFS | | EVYGHRLHNP |
TECPYNGSRR | | DDCQCRKDYT | | AAGFSSFQKI | | RIDLTSMQII | | TTDLQFARTS |
EGHPVPFATA | | GDCYSAAKCP | | QGRFSINLYG | | TGLSLTESAR | | WISQGNYAVS |
DIKKSPDGTR | | VVGKCGGYCG | | KCTPSSGTGL | | EVRVL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13202 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9P2N4 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24) |
---|
| Білки ADAM | |
---|
| Матриксні металопротеїнази | |
---|
|
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |