SPP1

SPP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3CXD, 3DSF

Ідентифікатори
Символи SPP1, BNSP, BSPI, ETA-1, OPN, secreted phosphoprotein 1, Osteopontin
Зовнішні ІД OMIM: 166490 MGI: 98389 HomoloGene: 20156 GeneCards: SPP1
Онтологія гена
Молекулярна функція

cytokine activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
extracellular matrix binding

Клітинна компонента

cell projection
extracellular region
perinuclear region of cytoplasm
екзосома
міжклітинний простір
комплекс Ґольджі
везикула
endoplasmic reticulum lumen

Біологічний процес

диференціація клітин
response to vitamin D
осифікація
biomineral tissue development
response to steroid hormone
extracellular matrix disassembly
extracellular matrix organization
response to organic substance
negative regulation of collateral sprouting of intact axon in response to injury
decidualization
inflammatory response
embryo implantation
osteoblast differentiation
positive regulation of bone resorption
адгезія клітин
androgen catabolic process
посттрансляційна модифікація
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
cellular response to testosterone stimulus
positive regulation of estradiol secretion
regulation of signaling receptor activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6696
20750
Ensembl
ENSG00000118785
ENSMUSG00000029304
UniProt
P10451
P10923
RefSeq (мРНК)
NM_001251830
NM_000582
NM_001040058
NM_001040060
NM_001251829
NM_001204201
NM_001204202
NM_001204203
NM_001204233
NM_009263
RefSeq (білок)
NP_000573
NP_001035147
NP_001035149
NP_001238758
NP_001238759
NP_001035147.1
NP_001191130
NP_001191131
NP_001191132
NP_001191162
NP_033289
Локус (UCSC) Хр. 4: 87.98 – 87.98 Mb Хр. 5: 104.58 – 104.59 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SPP1 (англ. Secreted phosphoprotein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 423[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRIAVICFCLLGITCAIPVKQADSGSSEEKQLYNKYPDAVATWLNPDPSQ
KQNLLAPQNAVSSEETNDFKQETLPSKSNESHDHMDDMDDEDDDDHVDSQ
DSIDSNDSDDVDDTDDSHQSDESHHSDESDELVTDFPTDLPATEVFTPVV
PTVDTYDGRGDSVVYGLRSKSKKFRRPDIQYPDATDEDITSHMESEELNG
AYKAIPVAQDLNAPSDWDSRGKDSYETSQLDDQSAETHSHKQSRLYKRKA
NDESNEHSDVIDSQELSKVSREFHSHEFHSHEDMLVVDPKSKEEDKHLKF
RISHELDSASSEVN

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Секретований назовні.

Література

  • Kiefer M.C., Bauer D.M., Barr P.J. (1989). The cDNA and derived amino acid sequence for human osteopontin. Nucleic Acids Res. 17: 3306—3306. PMID 2726470 DOI:10.1093/nar/17.8.3306
  • Crosby A.H., Edwards S.J., Murray J.C., Dixon M.J. (1995). Genomic organization of the human osteopontin gene: exclusion of the locus from a causative role in the pathogenesis of dentinogenesis imperfecta type II. Genomics. 27: 155—160. PMID 7665163 DOI:10.1006/geno.1995.1018
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Senger D.R., Perruzzi C.A., Papadopoulos A., Tenen D.G. (1989). Purification of a human milk protein closely similar to tumor-secreted phosphoproteins and osteopontin. Biochim. Biophys. Acta. 996: 43—48. PMID 2736258 DOI:10.1016/0167-4838(89)90092-7
  • Christensen B., Nielsen M.S., Haselmann K.F., Petersen T.E., Sorensen E.S. (2005). Post-translationally modified residues of native human osteopontin are located in clusters: identification of 36 phosphorylation and five O-glycosylation sites and their biological implications. Biochem. J. 390: 285—292. PMID 15869464 DOI:10.1042/BJ20050341
  • Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11255 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, P10451 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.