SLC1A6

Ідентифікатори

Символи

SLC1A6, EAAT4, solute carrier family 1 member 6

Зовнішні ІД

OMIM: 600637 MGI: 1096331 HomoloGene: 21055 GeneCards: SLC1A6

Реагує на сполуку

Онтологія гена
Молекулярна функція	• L-aspartate transmembrane transporter activity • symporter activity • L-glutamate transmembrane transporter activity • amino acid transmembrane transporter activity • high-affinity glutamate transmembrane transporter activity • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • intermediate filament cytoskeleton • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • glutamatergic synapse • integral component of presynaptic membrane
Біологічний процес	• chemical synaptic transmission • regulation of membrane potential • ion transport • glutamate secretion • aspartate transmembrane transport • L-glutamate transmembrane transport • L-glutamate import across plasma membrane • amino acid transport • L-aspartate transmembrane transport • neurotransmitter uptake • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6511


20513

Ensembl


ENSG00000105143


ENSMUSG00000005357

UniProt


P48664


O35544

RefSeq (мРНК)

NM_001272087 NM_001272088 NM_005071 NM_001384669 NM_001384670
NM_001384671


NM_009200

RefSeq (білок)


NP_001259016 NP_001259017 NP_005062


NP_033226

Локус (UCSC)

Хр. 19: 14.95 – 15.02 Mb

Хр. 10: 78.62 – 78.65 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SLC1A6 (англ. Solute carrier family 1 member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 564 амінокислот, а молекулярна маса — 61 565^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSHGNSLFL	RESGQRLGRV	GWLQRLQESL	QQRALRTRLR	LQTMTLEHVL
RFLRRNAFIL	LTVSAVVIGV	SLAFALRPYQ	LTYRQIKYFS	FPGELLMRML
QMLVLPLIVS	SLVTGMASLD	NKATGRMGMR	AAVYYMVTTI	IAVFIGILMV
TIIHPGKGSK	EGLHREGRIE	TIPTADAFMD	LIRNMFPPNL	VEACFKQFKT
QYSTRVVTRT	MVRTENGSEP	GASMPPPFSV	ENGTSFLENV	TRALGTLQEM
LSFEETVPVP	GSANGINALG	LVVFSVAFGL	VIGGMKHKGR	VLRDFFDSLN
EAIMRLVGII	IWYAPVGILF	LIAGKILEME	DMAVLGGQLG	MYTLTVIVGL
FLHAGIVLPL	IYFLVTHRNP	FPFIGGMLQA	LITAMGTSSS	SATLPITFRC
LEEGLGVDRR	ITRFVLPVGA	TVNMDGTALY	EALAAIFIAQ	VNNYELNLGQ
ITTISITATA	ASVGAAGIPQ	AGLVTMVIVL	TSVGLPTEDI	TLIIAVDWFL
DRLRTMTNVL	GDSIGAAVIE	HLSQRELELQ	EAELTLPSLG	KPYKSLMAQE
KGASRGRGGN	ESAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт амінокислот, симпортний транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, калію, іоном натрію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Fairman W.A., Vandenberg R.J., Arriza J.L., Kavanaugh M.P., Amara S.G. (1995). An excitatory amino-acid transporter with properties of a ligand-gated chloride channel. Nature. 375: 599—603. PMID 7791878 DOI:10.1038/375599a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Solute carrier family 1 member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10944 (англ.) . Архів оригіналу за 16 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P48664 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.