SF3B4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X5T, 1X5U

Ідентифікатори

Символи

SF3B4, AFD1, Hsh49, SAP49, SF3b49, splicing factor 3b subunit 4

Зовнішні ІД

OMIM: 605593 MGI: 109580 HomoloGene: 134086 GeneCards: SF3B4

Пов'язані генетичні захворювання

Nager acrofacial dysostosis^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• U12-type spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • spliceosomal complex • ядерце • U2-type precatalytic spliceosome • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10262


107701

Ensembl


ENSG00000143368


ENSMUSG00000068856

UniProt


Q15427 Q5SZ64


Q8QZY9

RefSeq (мРНК)


NM_005850


NM_153053

RefSeq (білок)


NP_005841


NP_694693

Локус (UCSC)

Хр. 1: 149.92 – 149.93 Mb

Хр. 3: 96.08 – 96.08 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SF3B4 (англ. Splicing factor 3b subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 424 амінокислот, а молекулярна маса — 44 386^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGPISERN	QDATVYVGGL	DEKVSEPLLW	ELFLQAGPVV	NTHMPKDRVT
GQHQGYGFVE	FLSEEDADYA	IKIMNMIKLY	GKPIRVNKAS	AHNKNLDVGA
NIFIGNLDPE	IDEKLLYDTF	SAFGVILQTP	KIMRDPDTGN	SKGYAFINFA
SFDASDAAIE	AMNGQYLCNR	PITVSYAFKK	DSKGERHGSA	AERLLAAQNP
LSQADRPHQL	FADAPPPPSA	PNPVVSSLGS	GLPPPGMPPP	GSFPPPVPPP
GALPPGIPPA	MPPPPMPPGA	AGHGPPSAGT	PGAGHPGHGH	SHPHPFPPGG
MPHPGMSQMQ	LAHHGPHGLG	HPHAGPPGSG	GQPPPRPPPG	MPHPGPPPMG
MPPRGPPFGS	PMGHPGPMPP	HGMRGPPPLM	PPHGYTGPPR	PPPYGYQRGP
LPPPRPTPRP	PVPPRGPLRG	PLPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Champion-Arnaud P., Reed R. (1994). The prespliceosome components SAP 49 and SAP 145 interact in a complex implicated in tethering U2 snRNP to the branch site. Genes Dev. 8: 1974—1983. PMID 7958871 DOI:10.1101/gad.8.16.1974
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
Golas M.M., Sander B., Will C.L., Luhrmann R., Stark H. (2003). Molecular architecture of the multiprotein splicing factor SF3b. Science. 300: 980—984. PMID 12738865 DOI:10.1126/science.1084155

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SF3B4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10771 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q15427 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.