PTPRD

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X5Z, 2DLH, 2YD6, 2YD7, 4RCA

Ідентифікатори

Символи

PTPRD, HPTP, HPTPD, HPTPDELTA, PTPD, RPTPDELTA, protein tyrosine phosphatase, receptor type D, protein tyrosine phosphatase receptor type D, R-PTP-delta

Зовнішні ІД

OMIM: 601598 HomoloGene: 88669 GeneCards: PTPRD

Пов'язані генетичні захворювання

епілепсія, ожиріння, короткозорість, синдром неспокійних ніг, цукровий діабет 2-го типу, focal epilepsy^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • phosphoprotein phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity • signaling receptor binding • cell adhesion molecule binding • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• екзосома • мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• presynaptic membrane assembly • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway • neuron differentiation • positive regulation of dendrite morphogenesis • GO:0016576 protein dephosphorylation • phosphate-containing compound metabolic process • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • positive regulation of synapse assembly • regulation of postsynaptic density assembly • trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex • synaptic membrane adhesion • regulation of presynapse assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5789


313278

Ensembl


ENSG00000153707 ENSG00000282932


ENSRNOG00000005711

UniProt


P23468 Q3KPI9


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_001040712 NM_001171025 NM_002839 NM_130391 NM_130392
NM_130393 NM_001377946 NM_001377947 NM_001377958 NM_001378058

XM_001067936
XM_003754043
XM_006225346
XM_006225347
XM_006225348

XM_006225349
XM_006225350
XM_006225351
XM_006225352
XM_006225353
XM_006225354
XM_006225356
XM_006225357
XM_006225358
XM_006225359
XM_006225360
XM_006225362
XM_006225363
XM_006225366
XM_006225370
XM_006225371
XM_006225372
XM_006225373
XM_006225375
XM_006225376
XM_006225377
XM_006225378
XM_006225379
XM_006225380
XM_008763819
XM_008763820
XM_008763821
XM_008763822
XM_008763823
XM_008763824
XM_008763825
XM_008763826
XM_008763827
XM_008763828
XM_008763829
XM_008763830
XM_008763831
XM_017593938
XM_017593939
XM_017593940
XM_017593941
XM_017593942
XM_017593943
XM_017593944
XM_017593945
XM_017593946
XM_017593947
XM_017593948
XM_017593949
XM_017593950
XM_017593951
XM_017593952
XM_017593953
XM_017593954
XM_017593955
XM_017593956
XM_017593957
XM_017602893
XM_017602894
XM_017602895
XM_017602896

RefSeq (білок)

NP_001035802 NP_001164496 NP_002830 NP_569075 NP_569076
NP_569077 NP_001364875 NP_001364876 NP_001364887 NP_001364987 NP_569077.2


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 9: 8.31 – 10.61 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTPRD (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 912 амінокислот, а молекулярна маса — 214 760^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVHVARLLLL	LLTFFLRTDA	ETPPRFTRTP	VDQTGVSGGV	ASFICQATGD
PRPKIVWNKK	GKKVSNQRFE	VIEFDDGSGS	VLRIQPLRTP	RDEAIYECVA
SNNVGEISVS	TRLTVLREDQ	IPRGFPTIDM	GPQLKVVERT	RTATMLCAAS
GNPDPEITWF	KDFLPVDTSN	NNGRIKQLRS	ESIGGTPIRG	ALQIEQSEES
DQGKYECVAT	NSAGTRYSAP	ANLYVRELRE	VRRVPPRFSI	PPTNHEIMPG
GSVNITCVAV	GSPMPYVKWM	LGAEDLTPED	DMPIGRNVLE	LNDVRQSANY
TCVAMSTLGV	IEAIAQITVK	ALPKPPGTPV	VTESTATSIT	LTWDSGNPEP
VSYYIIQHKP	KNSEELYKEI	DGVATTRYSV	AGLSPYSDYE	FRVVAVNNIG
RGPPSEPVLT	QTSEQAPSSA	PRDVQARMLS	STTILVQWKE	PEEPNGQIQG
YRVYYTMDPT	QHVNNWMKHN	VADSQITTIG	NLVPQKTYSV	KVLAFTSIGD
GPLSSDIQVI	TQTGVPGQPL	NFKAEPESET	SILLSWTPPR	SDTIANYELV
YKDGEHGEEQ	RITIEPGTSY	RLQGLKPNSL	YYFRLAARSP	QGLGASTAEI
SARTMQSKPS	APPQDISCTS	PSSTSILVSW	QPPPVEKQNG	IITEYSIKYT
AVDGEDDKPH	EILGIPSDTT	KYLLEQLEKW	TEYRITVTAH	TDVGPGPESL
SVLIRTNEDV	PSGPPRKVEV	EAVNSTSVKV	SWRSPVPNKQ	HGQIRGYQVH
YVRMENGEPK	GQPMLKDVML	ADAQWEFDDT	TEHDMIISGL	QPETSYSLTV
TAYTTKGDGA	RSKPKLVSTT	GAVPGKPRLV	INHTQMNTAL	IQWHPPVDTF
GPLQGYRLKF	GRKDMEPLTT	LEFSEKEDHF	TATDIHKGAS	YVFRLSARNK
VGFGEEMVKE	ISIPEEVPTG	FPQNLHSEGT	TSTSVQLSWQ	PPVLAERNGI
ITKYTLLYRD	INIPLLPMEQ	LIVPADTTMT	LTGLKPDTTY	DVKVRAHTSK
GPGPYSPSVQ	FRTLPVDQVF	AKNFHVKAVM	KTSVLLSWEI	PENYNSAMPF
KILYDDGKMV	EEVDGRATQK	LIVNLKPEKS	YSFVLTNRGN	SAGGLQHRVT
AKTAPDVLRT	KPAFIGKTNL	DGMITVQLPE	VPANENIKGY	YIIIVPLKKS
RGKFIKPWES	PDEMELDELL	KEISRKRRSI	RYGREVELKP	YIAAHFDVLP
TEFTLGDDKH	YGGFTNKQLQ	SGQEYVFFVL	AVMEHAESKM	YATSPYSDPV
VSMDLDPQPI	TDEEEGLIWV	VGPVLAVVFI	ICIVIAILLY	KRKRAESDSR
KSSIPNNKEI	PSHHPTDPVE	LRRLNFQTPG	MASHPPIPIL	ELADHIERLK
ANDNLKFSQE	YESIDPGQQF	TWEHSNLEVN	KPKNRYANVI	AYDHSRVLLS
AIEGIPGSDY	VNANYIDGYR	KQNAYIATQG	SLPETFGDFW	RMIWEQRSAT
VVMMTKLEER	SRVKCDQYWP	SRGTETHGLV	QVTLLDTVEL	ATYCVRTFAL
YKNGSSEKRE	VRQFQFTAWP	DHGVPEHPTP	FLAFLRRVKT	CNPPDAGPMV
VHCSAGVGRT	GCFIVIDAML	ERIKHEKTVD	IYGHVTLMRA	QRNYMVQTED
QYIFIHDALL	EAVTCGNTEV	PARNLYAYIQ	KLTQIETGEN	VTGMELEFKR
LASSKAHTSR	FISANLPCNK	FKNRLVNIMP	YESTRVCLQP	IRGVEGSDYI
NASFIDGYRQ	QKAYIATQGP	LAETTEDFWR	MLWEHNSTIV	VMLTKLREMG
REKCHQYWPA	ERSARYQYFV	VDPMAEYNMP	QYILREFKVT	DARDGQSRTV
RQFQFTDWPE	QGVPKSGEGF	IDFIGQVHKT	KEQFGQDGPI	SVHCSAGVGR
TGVFITLSIV	LERMRYEGVV	DIFQTVKMLR	TQRPAMVQTE	DQYQFSYRAA
LEYLGSFDHY	AT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Pulido R., Krueger N.X., Serra-Pages C., Saito H., Streuli M. (1995). Molecular characterization of the human transmembrane protein-tyrosine phosphatase delta. Evidence for tissue-specific expression of alternative human transmembrane protein-tyrosine phosphatase delta isoforms. J. Biol. Chem. 270: 6722—6728. PMID 7896816 DOI:10.1074/jbc.270.12.6722
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Krueger N.X., Streuli M., Saito H. (1990). Structural diversity and evolution of human receptor-like protein tyrosine phosphatases. EMBO J. 9: 3241—3252. PMID 2170109

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPRD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9668 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P23468 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.