HLA-B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB

3VCL, 4U1H, 4U1K, 5EO1, 5EO0,%%s1AGB, 1AGC, 1AGD, 1AGE, 1AGF, 1M05, 1MI5, 3FFC, 3SJV, 3SKM, 3SKO, 3SPV, 3X13, 3X14, 4QRP, 4QRQ, 4QRS, 4QRT, 4QRU,%%s4O2C, 4O2E, 4O2F,%%s3LN4, 3LN5,%%s4U1J, 4U1M, 4U1N,%%s4U1I, 4U1L, 4U1S,%%s1HSA, 1JGD, 1JGE, 1K5N, 1OF2, 1OGT, 1UXS, 1UXW, 1W0V, 1W0W, 2A83, 2BSR, 2BSS, 2BST, 3B3I, 3B6S, 3BP4, 3BP7, 3CZF, 3D18, 3DTX, 3HCV, 3LV3, 4G8G, 4G8I, 4G9D, 4G9F, 5DEF, 5DEG,%%s1A1N, 1A9B, 1A9E, 1CG9, 1XH3, 1ZHK, 1ZHL, 1ZSD, 2AK4, 2AXF, 2AXG, 2H6P, 2NW3, 2NX5, 3BW9, 3BWA, 3KWW, 3KXF, 3LKN, 3LKO, 3LKP, 3LKQ, 3LKR, 3LKS, 3MV7, 3MV8, 3MV9, 3VFS, 3VFT, 3VFU, 3VFV, 3VFW, 4LNR, 4PR5, 4PRN, 4QRR,%%s1A1M, 1A1O,%%s2BVO, 2BVP, 2BVQ, 2HJL, 2RFX, 2YPK, 2YPL, 3UPR, 3VH8, 3VRI, 3VRJ, 3WUW, 3X11, 3X12, 5B39, 5B38,%%s4JQV, 4XXC,%%s1XR8, 1XR9, 3C9N,%%s4LCY,%%s1M6O, 1N2R, 1SYV, 3DX6, 3DX7, 3DX8, 3DXA, 3KPL, 3KPM, 3KPN, 3KPO, 3KPP, 3KPQ, 3KPR, 3KPS, 3L3D, 3L3G, 3L3I, 3L3J, 4JQX,%%s1E27, 1E28, 4MJI,%%s3W39

Ідентифікатори

Символи

HLA-B, AS, SPDA1, Bw-47, Bw-50, major histocompatibility complex, class I, B, B-4901, B-5001, HEL-S-83, HLA-B*45ZJ, HLA-B-3506, HLA-B-3905, HLA-B-5502, HLA-B-5602, HLA-B15, HLA-B39, HLA-B49, HLA-B50, HLA-B55, HLA-B59, HLA-B61, HLA-Cw, HLA-DRB1

Зовнішні ІД

HomoloGene: 134029 GeneCards: HLA-B

Пов'язані генетичні захворювання

ВІЛ-заворювання^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding • peptide antigen binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • early endosome membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • ендоплазматичний ретикулум • MHC class I protein complex • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • екзосома • secretory granule membrane • recycling endosome membrane
Біологічний процес	• antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of interleukin-12 production • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • regulation of dendritic cell differentiation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • protection from natural killer cell mediated cytotoxicity • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of immune response • regulation of T cell anergy • GO:0022415 viral process • regulation of interleukin-6 production • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3106


30757

Ensembl

ENSG00000228964 ENSG00000234745 ENSG00000206450 ENSG00000224608 ENSG00000223532
ENSG00000232126


ENSDARG00000075963

UniProt


P01889


Q31365

RefSeq (мРНК)


NM_005514


NM_131471

RefSeq (білок)


NP_005505


NP_571546

Локус (UCSC)

Хр. 6: 31.35 – 31.37 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HLA-B (англ. HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 40 460^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLVMAPRTVL	LLLSAALALT	ETWAGSHSMR	YFYTSVSRPG	RGEPRFISVG
YVDDTQFVRF	DSDAASPREE	PRAPWIEQEG	PEYWDRNTQI	YKAQAQTDRE
SLRNLRGYYN	QSEAGSHTLQ	SMYGCDVGPD	GRLLRGHDQY	AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA	DTAAQITQRK	WEAAREAEQR	RAYLEGECVE	WLRRYLENGK
DKLERADPPK	THVTHHPISD	HEATLRCWAL	GFYPAEITLT	WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA	GDRTFQKWAA	VVVPSGEEQR	YTCHVQHEGL	PKPLTLRWEP
SSQSTVPIVG	IVAGLAVLAV	VVIGAVVAAV	MCRRKSSGGK	GGSYSQAACS
DSAQGSDVSL	TA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

Ennis P.D., Zemmour J., Salter R.D., Parham P. (1990). Rapid cloning of HLA-A,B cDNA by using the polymerase chain reaction: frequency and nature of errors produced in amplification. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2833—2837. PMID 2320591 DOI:10.1073/pnas.87.7.2833
Bergmans A., Tijssen H., Lardy J., Reekers P. (1993). Complete nucleotide sequence of HLA-B*0703, a B7-variant (BPOT). Hum. Immunol. 38: 159—162. PMID 8106270 DOI:10.1016/0198-8859(93)90533-7
Kubens B.S., Arnett K.L., Adams E.J., Parham P., Grosse-Wilde H. (1995). Definition of a new HLA-B7 subtype (B*0704) by isoelectric focusing, family studies and DNA sequence analysis. Tissue Antigens. 45: 322—327. PMID 7652739 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02461.x
Arnett K.L., Adams E.J., Domena J.D., Parham P. (1994). Structure of a novel subtype of B7 (B*0705) isolated from a Chinese individual. Tissue Antigens. 44: 318—321. PMID 7878658 DOI:10.1111/j.1399-0039.1994.tb02402.x
Middleton D., Curran M.D., Anholts J.D., Reilly E.R., Schreuder G.M. (2001). Characterisation of a new HLA-B allele, HLA-B*0724. Tissue Antigens. 57: 471—473. PMID 11556973 DOI:10.1034/j.1399-0039.2001.057005471.x
Orr H.T., Lopez de Castro J.A., Lancet D., Strominger J.L. (1979). Complete amino acid sequence of a papain-solubilized human histocompatibility antigen, HLA-B7. 2. Sequence determination and search for homologies. Biochemistry. 18: 5711—5720. PMID 518865 DOI:10.1021/bi00592a030

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HLA-B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4932 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P01889 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.