BACE1

BACE1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1FKN, 1M4H, 1PY1, 1SGZ, 1TQF, 1UJJ, 1UJK, 1W50, 1W51, 1XN2, 1XN3, 1XS7, 1YM2, 1YM4, 2B8L, 2B8V, 2F3E, 2F3F, 2FDP, 2G94, 2HIZ, 2HM1, 2IQG, 2IRZ, 2IS0, 2NTR, 2OAH, 2OF0, 2OHK, 2OHL, 2OHM, 2OHN, 2OHP, 2OHQ, 2OHR, 2OHS, 2OHT, 2OHU, 2P4J, 2P83, 2P8H, 2PH6, 2PH8, 2Q11, 2Q15, 2QK5, 2QMD, 2QMF, 2QMG, 2QP8, 2QU2, 2QU3, 2QZK, 2QZL, 2VA5, 2VA6, 2VA7, 2VIE, 2VIJ, 2VIY, 2VIZ, 2VJ6, 2VJ7, 2VJ9, 2VKM, 2VNM, 2VNN, 2WEZ, 2WF0, 2WF1, 2WF2, 2WF3, 2WF4, 2WJO, 2XFI, 2XFJ, 2XFK, 2ZDZ, 2ZE1, 2ZHR, 2ZHS, 2ZHT, 2ZHU, 2ZHV, 2ZJH, 2ZJI, 2ZJJ, 2ZJK, 2ZJL, 2ZJM, 2ZJN, 3BRA, 3BUF, 3BUG, 3BUH, 3CIB, 3CIC, 3CID, 3CKP, 3CKR, 3DM6, 3DUY, 3DV1, 3DV5, 3EXO, 3FKT, 3H0B, 3HVG, 3HW1, 3I25, 3IGB, 3IN3, 3IN4, 3IND, 3INE, 3INF, 3INH, 3IVH, 3IVI, 3IXJ, 3IXK, 3KYR, 3L38, 3L3A, 3LHG, 3LNK, 3MSJ, 3MSK, 3MSL, 3N4L, 3NSH, 3OOZ, 3QI1, 3R1G, 3RSV, 3RTM, 3RVI, 3S2O, 3S7L, 3S7M, 3TPJ, 3TPL, 3TPP, 3TPR, 3UDH, 3UDJ, 3UDK, 3UDM, 3UDN, 3UDP, 3UDQ, 3UDR, 3UDY, 3UFL, 3UQP, 3UQR, 3UQU, 3UQW, 3UQX, 3VEU, 3VF3, 3VG1, 3VV6, 3VV7, 3ZMG, 3ZOV, 4ACU, 4ACX, 4AZY, 4B00, 4B05, 4B0Q, 4B1C, 4B1D, 4B1E, 4B70, 4B72, 4B77, 4B78, 4BEK, 4BFD, 4D83, 4D85, 4D88, 4D89, 4D8C, 4DH6, 4DI2, 4DJU, 4DJV, 4DJW, 4DJX, 4DJY, 4DPF, 4DPI, 4DUS, 4DV9, 4DVF, 4EWO, 4EXG, 4FCO, 4FGX, 4FM7, 4FM8, 4FRI, 4FRJ, 4FRK, 4FRS, 4FS4, 4FSE, 4FSL, 4GMI, 4H1E, 4H3F, 4H3G, 4H3I, 4H3J, 4HA5, 4HZT, 4I0E, 4I0F, 4I0G, 4I0H, 4I0J, 4I0Z, 4I10, 4I11, 4I12, 4I1C, 4J0T, 4J0V, 4J0Y, 4J0Z, 4J17, 4J1C, 4J1E, 4J1F, 4J1H, 4J1I, 4J1K, 4JOO, 4JP9, 4JPC, 4JPE, 4K8S, 4K9H, 4KE0, 4KE1, 3K5C, 3K5D, 3K5F, 3K5G, 3KMX, 3KMY, 3KN0, 3L58, 3L59, 3L5B, 3L5C, 3L5D, 3L5E, 3L5F, 3LPI, 3LPJ, 3LPK, 3OHF, 3OHH, 3PI5, 3QBH, 3R2F, 3RSX, 3RTH, 3RTN, 3RU1, 3SKF, 3SKG, 3U6A, 4GID, 4LXA, 4LXK, 4LXM, 3WB4, 3WB5, 4I0D, 4I0I, 4IVS, 4IVT, 4J0P, 4L7G, 4L7H, 4L7J, 4LC7, 4N00, 4PZW, 4PZX, 4R5N, 4R8Y, 4R91, 4R92, 4R93, 4R95, 4RCD, 4RCE, 4RCF, 4RRN, 4RRO, 4RRS, 4WY1, 4WY6, 4X2L, 4X7I, 4XKX, 4XXS, 4YBI, 4TRW, 4TRZ, 4ZSM, 4ZSP, 4ZSQ, 4ZSR, 4TRY, 4ZPF, 4ZPG, 5CLM, 5F01, 5EZZ, 5DQC, 5F00, 5EZX, 5HE7, 5HD0, 5HDX, 5HDV, 5HE5, 5HE4, 5HDU, 5HDZ, 5I3X, 5I3W, 5I3V, 5IE1, 5I3Y, 5ENK

Ідентифікатори
Символи BACE1, ASP2, BACE, HSPC104, beta-secretase 1
Зовнішні ІД OMIM: 604252 MGI: 1346542 HomoloGene: 8014 GeneCards: BACE1
шифр КФ 3.4.23.46
Онтологія гена
Молекулярна функція

endopeptidase activity
amyloid-beta binding
beta-aspartyl-peptidase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
enzyme binding
hydrolase activity
GO:0070122 peptidase activity
aspartic-type endopeptidase activity

Клітинна компонента

multivesicular body
late endosome
endoplasmic reticulum lumen
мембрана
клітинна мембрана
cell surface
аксон
ендоплазматичний ретикулум
Golgi-associated vesicle lumen
endosome membrane
cytoplasmic vesicle membrane
GO:0016023 cytoplasmic vesicle
integral component of plasma membrane
membrane raft
комплекс Ґольджі
integral component of membrane
ендосома
trans-Golgi network
лізосома
early endosome
Синаптичні бульбашки
дендрит (нейробіологія)
neuronal cell body
recycling endosome
hippocampal mossy fiber to CA3 synapse
presynapse

Біологічний процес

GO:0044257 protein catabolic process
протеоліз
amyloid-beta metabolic process
membrane protein ectodomain proteolysis
modulation of chemical synaptic transmission
response to radiation
response to lead ion
positive regulation of neuron apoptotic process
detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain
prepulse inhibition
cellular response to copper ion
cellular response to manganese ion
cellular response to amyloid-beta
regulation of synaptic vesicle exocytosis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23621
23821
Ensembl
ENSG00000186318
ENSMUSG00000032086
UniProt
P56817
P56818
RefSeq (мРНК)
NM_138973
NM_001207048
NM_001207049
NM_012104
NM_138971
NM_138972
NM_001145947
NM_011792
RefSeq (білок)
NP_001193977
NP_001193978
NP_036236
NP_620427
NP_620428
NP_620429
NP_036236.1
NP_001139419
NP_035922
Локус (UCSC) Хр. 11: 117.29 – 117.32 Mb Хр. 9: 45.75 – 45.78 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BACE1 (англ. Beta-secretase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 55 764[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAQALPWLLLWMGAGVLPAHGTQHGIRLPLRSGLGGAPLGLRLPRETDEE
PEEPGRRGSFVEMVDNLRGKSGQGYYVEMTVGSPPQTLNILVDTGSSNFA
VGAAPHPFLHRYYQRQLSSTYRDLRKGVYVPYTQGKWEGELGTDLVSIPH
GPNVTVRANIAAITESDKFFINGSNWEGILGLAYAEIARPDDSLEPFFDS
LVKQTHVPNLFSLQLCGAGFPLNQSEVLASVGGSMIIGGIDHSLYTGSLW
YTPIRREWYYEVIIVRVEINGQDLKMDCKEYNYDKSIVDSGTTNLRLPKK
VFEAAVKSIKAASSTEKFPDGFWLGEQLVCWQAGTTPWNIFPVISLYLMG
EVTNQSFRITILPQQYLRPVEDVATSQDDCYKFAISQSSTGTVMGAVIME
GFYVVFDRARKRIGFAVSACHVHDEFRTAAVEGPFVTLDMEDCGYNIPQT
DESTLMTIAYVMAAICALFMLPLCLMVCQWRCLRCLRQQHDDFADDISLL
K

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, аспартилових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

  • Tanahashi H., Tabira T. (2001). Three novel alternatively spliced isoforms of the human beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme (BACE) and their effect on amyloid beta-peptide production. Neurosci. Lett. 307: 9—12. PMID 11516562 DOI:10.1016/S0304-3940(01)01912-7
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Yan R., Han P., Miao H., Greengard P., Xu H. (2001). The transmembrane domain of the Alzheimer's beta-secretase (BACE1) determines its late Golgi localization and access to beta -amyloid precursor protein (APP) substrate. J. Biol. Chem. 276: 36788—36796. PMID 11466313 DOI:10.1074/jbc.M104350200
  • Fischer F., Molinari M., Bodendorf U., Paganetti P. (2002). The disulphide bonds in the catalytic domain of BACE are critical but not essential for amyloid precursor protein processing activity. J. Neurochem. 80: 1079—1088. PMID 11953458 DOI:10.1046/j.0022-3042.2002.00806.x
  • Costantini C., Ko M.H., Jonas M.C., Puglielli L. (2007). A reversible form of lysine acetylation in the ER and Golgi lumen controls the molecular stabilization of BACE1. Biochem. J. 407: 383—395. PMID 17425515 DOI:10.1042/BJ20070040
  • Jonas M.C., Costantini C., Puglielli L. (2008). PCSK9 is required for the disposal of non-acetylated intermediates of the nascent membrane protein BACE1. EMBO Rep. 9: 916—922. PMID 18660751 DOI:10.1038/embor.2008.132

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:933 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2018. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, P56817 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»