Циклін-залежна кіназа 9

CDK9

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3BLH, 3BLQ, 3BLR, 3LQ5, 3MI9, 3MIA, 3MY1, 3TN8, 3TNH, 3TNI, 4BCF, 4BCG, 4BCH, 4BCI, 4BCJ, 4EC8, 4EC9, 4IMY, 4OGR, 4OR5

Ідентифікатори

Символи

CDK9, C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, cyclin-dependent kinase 9, cyclin dependent kinase 9

Зовнішні ІД

OMIM: 603251 MGI: 1328368 HomoloGene: 55566 GeneCards: CDK9

Реагує на сполуку

dinaciclib, seliciclib^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • transferase activity • protein kinase activity • 7SK snRNA binding • transcription coactivator binding • snRNA binding • ATP binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • DNA binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein serine/threonine kinase activity • chromatin binding • kinase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • protein kinase binding • cyclin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • мембрана • нуклеоплазма • transcription elongation factor complex • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • PML body • хромосома • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex
Біологічний процес	• positive regulation of cardiac muscle hypertrophy • positive regulation of mRNA 3'-UTR binding • regulation of muscle cell differentiation • negative regulation of mRNA polyadenylation • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to cytokine stimulus • positive regulation of viral transcription • replication fork processing • protein phosphorylation • GO:0033127, GO:2000281, GO:2000817 regulation of histone modification • regulation of mitotic cell cycle • cellular response to DNA damage stimulus • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of DNA repair • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • проліферація • transcription by RNA polymerase II • фосфорилювання • positive regulation of histone H2B ubiquitination • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1025


107951

Ensembl


ENSG00000136807


ENSMUSG00000009555

UniProt


P50750


Q99J95

RefSeq (мРНК)


NM_001261


NM_130860

RefSeq (білок)


NP_001252 NP_001252.1


NP_570930

Локус (UCSC)

Хр. 9: 127.79 – 127.79 Mb

Хр. 2: 32.6 – 32.6 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDK9 (англ. Cyclin dependent kinase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 42 778^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKQYDSVEC	PFCDEVSKYE	KLAKIGQGTF	GEVFKARHRK	TGQKVALKKV
LMENEKEGFP	ITALREIKIL	QLLKHENVVN	LIEICRTKAS	PYNRCKGSIY
LVFDFCEHDL	AGLLSNVLVK	FTLSEIKRVM	QMLLNGLYYI	HRNKILHRDM
KAANVLITRD	GVLKLADFGL	ARAFSLAKNS	QPNRYTNRVV	TLWYRPPELL
LGERDYGPPI	DLWGAGCIMA	EMWTRSPIMQ	GNTEQHQLAL	ISQLCGSITP
EVWPNVDNYE	LYEKLELVKG	QKRKVKDRLK	AYVRDPYALD	LIDKLLVLDP
AQRIDSDDAL	NHDFFWSDPM	PSDLKGMLST	HLTSMFEYLA	PPRRKGSQIT
QQSTNQSRNP	ATTNQTEFER	VF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Best J.L., Presky D.H., Swerlick R.A., Burns D.K., Chu W. (1995). Cloning of a full-length cDNA sequence encoding a cdc2-related protein kinase from human endothelial cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 208: 562—568. PMID 7695608 DOI:10.1006/bbrc.1995.1375
Liu H., Rice A.P. (2000). Genomic organization and characterization of promoter function of the human CDK9 gene. Gene. 252: 51—59. PMID 10903437 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00215-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wei P., Garber M.E., Fang S.-M., Fischer W.H., Jones K.A. (1998). A novel CDK9-associated C-type cyclin interacts directly with HIV-1 Tat and mediates its high-affinity, loop-specific binding to TAR RNA. Cell. 92: 451—462. PMID 9491887 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80939-3
Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Watanabe D., Handa H. (1998). Evidence that P-TEFb alleviates the negative effect of DSIF on RNA polymerase II-dependent transcription in vitro. EMBO J. 17: 7395—7403. PMID 9857195 DOI:10.1093/emboj/17.24.7395
Peng J.-M., Zhu Y., Milton J.T., Price D.H. (1998). Identification of multiple cyclin subunits of human P-TEFb. Genes Dev. 12: 755—762. PMID 9499409 DOI:10.1101/gad.12.5.755

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cyclin dependent kinase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1780 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P50750 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.