GTPaze

GTPaze su velika familija enzima hidrolaza koji mogu da se vežu i hidrolizuju guanozin trifosfat (GTP). GTP vezivanje i hidroliza se odvijaju u visoko konzerviranom G domenu zajedničkom za sve GTPaze.[1]

Funkcije

GTPaze imaju važnu ulogu u:

Mehanizam

Hidroliza GTP γ fosfata guanozin-difosfat (GDP) i Pi, neorganski fosfat, se odvija SN2 mehanizmom (nukleofilnom supstitucijom) putem pentavalentnog intermedijarnog stanja, i zavisna je od magnezijumovih jona (Mg2+).

Glavni motivi

Kod većine GTPaza, specifičnost za bazu guanin je data motivom za prepoznavanje baze, koji ima konsenzus sekvencu [N/T]KXD.[2]

Vidi još

Literatura

  • Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  1. ^ Scheffzek K, Ahmadian MR (2005). „GTPase activating proteins: structural and functional insights 18 years after discovery”. Cellular and Molecular Life Sciences : CMLS. 62 (24): 3014—38. PMID 16314935. doi:10.1007/s00018-005-5136-x. 
  2. ^ Leipe D.D., Wolf Y.I., Koonin E.V., and Aravind, L. (2002). „Classification and evolution of P-loop GTPases and related ATPases”. J Mol Bio. 317 (1): 41—72. PMID 11916378. doi:10.1006/jmbi.2001.5378. CS1 одржавање: Вишеструка имена: списак аутора (веза)

Spoljašnje veze

  • GTPase на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
  • п
  • р
  • у
3.6.1
Pirofosfataza (Neorganska, Tiamin) · Apiraza · Tiamin trifosfataza
3.6.23.6.3-4: ATPaza
3.6.3
Cu++ (3.6.3.4)
Menkes/ATP7A · Vilson/ATP7B
Ca+ (3.6.3.8)
SERCA (ATP2A1, ATP2A2, ATP2A3) · Membrana plazme (ATP2B1, ATP2B2, ATP2B3, ATP2B4) · SPCA (ATP2C1, ATP2C2)
Na+/K+ (3.6.3.9)
ATP1A1 · ATP1A2 · ATP1A3 · ATP1A4 · ATP1B1 · ATP1B2 · ATP1B3 · ATP1B4
H+/K+ (3.6.3.10)
ATP4A
Druge P-tip ATPaze
ATP8B1 · ATP10A · ATP11B · ATP12A · ATP13A2 · ATP13A3 ·
3.6.4
3.6.5: GTPaze
3.6.5.1: Heterotrimerni G protein
Gαs · Gαi (GNAI1, GNAI2, GNAI3) · Gαq/11 (GNAQ, GNA11) · Gα12/13 (GNA12, GNA13) · Transducin (GNAT1, GNAT2)
3.6.5.2: Male GTPaze > Ras superfamilija
Ras · Rab (Rab27) · Arf (Arf6) · Ran · Rheb · Ro familija (RhoA, RhoB, CDC42, Rac1) · Rap
3.6.5.3: GTPaza proteinske sinteze
Prokariotski (IF-2, EF-Tu, EF-G) · Eukariotski
3.6.5.5-6: Polimerizacioni motori
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • п
  • р
  • у
Teme
Tipovi
  • B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
Portali:
  •  Molekularna i ćelijska biologija
  •  Hemija