LMNA

LMNA
Structure de la protéine LMNA. Basé sur l'identifiant PDB 1iFR.
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1IFR, 1IVT, 1X8Y, 2XV5, 2YPT, 3GEF, 3V4Q, 3V4W, 3V5B

Identifiants
AliasesLMNA
IDs externesOMIM: 150330 MGI: 96794 HomoloGene: 41321 GeneCards: LMNA
Position du gène (Homme)
Chromosome 1 humain
Chr.Chromosome 1 humain[1]
Chromosome 1 humain
Localisation génomique pour LMNA
Localisation génomique pour LMNA
Locus1q22Début156,082,573 bp[1]
Fin156,140,081 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 3 (souris)
Chr.Chromosome 3 (souris)[2]
Chromosome 3 (souris)
Localisation génomique pour LMNA
Localisation génomique pour LMNA
Locus3 F1|3 38.84 cMDébut88,387,454 bp[2]
Fin88,417,263 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • mamelon

  • muqueuse gastrique

  • skin of abdomen

  • vésicule biliaire

  • stromal cell of endometrium

  • tendon calcanéen

  • left uterine tube

  • aorte ascendante

  • veine cave

  • Veine saphène
Fortement exprimé dans
  • aorte ascendante

  • valve aortique

  • artère carotide externe

  • artère carotide interne

  • lèvre

  • condyle

  • skin of back

  • fosse

  • calvaria

  • œsophage
Plus de données d'expression de référence
BioGPS




Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • structural molecule activity
  • liaison protéique
  • identical protein binding
Composant cellulaire
  • Lamina
  • cytosol
  • nuclear speck
  • lamin filament
  • perinuclear region of cytoplasm
  • Filament intermédiaire
  • noyau
  • matrice extracellulaire
  • membrane nucléaire
  • nucléoplasme
  • enveloppe nucléaire
Processus biologique
  • regulation of cell migration
  • organisation d'un noyau
  • establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity
  • negative regulation of release of cytochrome c from mitochondria
  • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway
  • muscle organ development
  • regulation of protein localization to nucleus
  • IRE1-mediated unfolded protein response
  • mitotic nuclear membrane disassembly
  • protein localization to nucleus
  • mitotic nuclear membrane reassembly
  • ventricular cardiac muscle cell development
  • cellular response to hypoxia
  • positive regulation of gene expression
  • negative regulation of mesenchymal cell proliferation
  • organisation de l'enveloppe nucléaire
  • negative regulation of cell population proliferation
  • regulation of telomere maintenance
  • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy in response to stress
  • protein import into nucleus
  • regulation of protein stability
  • positive regulation of histone H3-K9 trimethylation
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

4000

16905

Ensembl

ENSG00000160789

ENSMUSG00000028063

UniProt

P02545

P48678

RefSeq (mRNA)
NM_001257374
NM_001282624
NM_001282625
NM_001282626
NM_005572

NM_170707
NM_170708

NM_001002011
NM_001111102
NM_019390

RefSeq (protéine)
NP_001244303
NP_001269553
NP_001269554
NP_001269555
NP_005563

NP_733821
NP_733822

NP_001002011
NP_001104572
NP_062263

Localisation (UCSC)Chr 1: 156.08 – 156.14 MbChr 3: 88.39 – 88.42 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

LMNA est un gène situé sur le chromosome 1 humain. Il permet la synthèse des lamines A et C par épissage alternatif.

En médecine

Les mutations de ce gènes sont impliquées dans plusieurs maladies, appelées laminopathies :

Certaines maladies sont proches et la distinction entre ces syndromes n'est pas toujours nette, avec des manifestations pouvant recouvrir plusieurs de ces atteintes[12].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160789 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028063 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Fatkin D, MacRae C, Sasaki T et al. Missense mutations in the rod domain of the lamin A/C gene as causes of dilated cardiomyopathy and conduction-system disease, N Engl J Med, 1999;341:1715–1724
  6. Hasselberg NE, Haland TF, Saberniak J et al. Lamin A/C cardiomyopathy: young onset, high penetrance, and frequent need for heart transplantations, Eur Heart J, 2018;39:853–860
  7. Kayvanpour E, Sedaghat-Hamedani F, Amr A et al. Genotype-phenotype associations in dilated cardiomyopathy: meta-analysis on more than 8000 individuals, Clin Res Cardiol, 2017;106:127–139
  8. Bonne G, Di Barletta MR, Varnous S et al. Mutations in the gene encoding lamin A/C cause autosomal dominant Emery–Dreifuss muscular dystrophy, Nat Genet, 1999;21:285–288.
  9. Shackleton S, Lloyd DJ, Jackson SN et al. LMNA, encoding lamin A/C, is mutated in partial lipodystrophy, Nat Genet, 2000;24:153–156
  10. Genschel J, Schmidt HH, Mutations in the LMNA gene encoding lamin A/C, Hum Mutat, 2000;16:451–459
  11. Broers JL, Ramaekers FC, Bonne G, Yaou RB, Hutchison CJ, Nuclear lamins: laminopathies and their role in premature ageing, Physiol Rev, 2006;86:967–1008
  12. Ambrosi P, Kreitmann B, Lepidi H, Habib G, Levy N, Philip N, De Sandre-Giovannoli A, A novel overlapping phenotype characterized by lipodystrophy, mandibular dysplasia, and dilated cardiomyopathy associated with a new mutation in the LMNA gene, Int J Cardiol, 2016;209:317–318
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