LDLR

LDLR
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1AJJ, 1D2J, 1F5Y, 1HJ7, 1HZ8, 1I0U, 1IJQ, 1LDL, 1LDR, 1N7D, 1XFE, 2FCW, 2KRI, 2LGP, 2W2M, 2W2N, 2W2O, 2W2P, 2W2Q, 3BPS, 3GCW, 3GCX, 3M0C, 3SO6, 2M7P, 2MG9, 3P5B, 3P5C, 4NE9

Identifiants
AliasesLDLR
IDs externesOMIM: 606945 MGI: 96765 HomoloGene: 55469 GeneCards: LDLR
Position du gène (Homme)
Chromosome 19 humain
Chr.Chromosome 19 humain[1]
Chromosome 19 humain
Localisation génomique pour LDLR
Localisation génomique pour LDLR
Locus19p13.2Début11,089,462 bp[1]
Fin11,133,820 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 9 (souris)
Chr.Chromosome 9 (souris)[2]
Chromosome 9 (souris)
Localisation génomique pour LDLR
Localisation génomique pour LDLR
Locus9 A3|9 7.87 cMDébut21,634,779 bp[2]
Fin21,661,215 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • lobe inférieur du poumon

  • right adrenal gland

  • left adrenal gland

  • stromal cell of endometrium

  • upper lobe of lung

  • upper lobe of left lung

  • mucosa of urinary bladder

  • poumon droit

  • îlot de Langerhans

  • left uterine tube
Fortement exprimé dans
  • cumulus cell

  • nerf ischiatique

  • aorte ascendante

  • otic placode

  • îlot de Langerhans

  • glande surrénale

  • left lobe of liver

  • iris

  • articulation talo-crurale

  • corps ciliaire
Plus de données d'expression de référence
BioGPS




Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • Calcium liaison ionique
  • clathrin heavy chain binding
  • virus receptor activity
  • liaison protéique
  • liaison de protéase
  • identical protein binding
  • very-low-density lipoprotein particle receptor activity
  • low-density lipoprotein particle receptor activity
  • low-density lipoprotein particle binding
  • amyloid-beta binding
Composant cellulaire
  • integral component of membrane
  • clathrin-coated endocytic vesicle membrane
  • endosome
  • late endosome
  • appareil de Golgi
  • membrane
  • receptor complex
  • membrane plasmique
  • partie apicale d'une cellule
  • integral component of plasma membrane
  • surface cellulaire
  • basolateral plasma membrane
  • early endosome
  • low-density lipoprotein particle
  • clathrin-coated pit
  • lysosome
  • PCSK9-LDLR complex
  • endosome membrane
  • external side of plasma membrane
  • milieu extracellulaire
  • endolysosome membrane
  • sorting endosome
  • intracellulaire
  • somatodendritic compartment
Processus biologique
  • positive regulation of triglyceride biosynthetic process
  • regulation of phosphatidylcholine catabolic process
  • processus métabolique stéroidique
  • lipid transport
  • endocytose
  • processus métabolique lipidique
  • phospholipid transport
  • cholesterol transport
  • cholesterol metabolic process
  • lipoprotein catabolic process
  • intestinal cholesterol absorption
  • transport
  • pénétration virale
  • cholesterol homeostasis
  • viral process
  • positive regulation of gene expression
  • positive regulation of inflammatory response
  • lipoprotein metabolic process
  • cellular response to fatty acid
  • negative regulation of gene expression
  • organisation d'une membrane
  • cholesterol import
  • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus
  • receptor-mediated endocytosis involved in cholesterol transport
  • chylomicron remnant clearance
  • low-density lipoprotein particle clearance
  • endocytose à récepteur
  • phagocytose
  • mémoire à long terme
  • plasma lipoprotein particle clearance
  • high-density lipoprotein particle clearance
  • regulation of protein metabolic process
  • negative regulation of protein metabolic process
  • response to caloric restriction
  • negative regulation of astrocyte activation
  • regulation of cholesterol metabolic process
  • amyloid-beta clearance
  • amyloid-beta clearance by cellular catabolic process
  • negative regulation of microglial cell activation
  • positive regulation of lysosomal protein catabolic process
  • negative regulation of amyloid fibril formation
  • artery morphogenesis
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

3949

16835

Ensembl

ENSG00000130164

ENSMUSG00000032193

UniProt

P01130

P35951

RefSeq (mRNA)
NM_000527
NM_001195798
NM_001195799
NM_001195800
NM_001195802

NM_001195803

NM_001252658
NM_001252659
NM_010700

RefSeq (protéine)

NP_000518
NP_001182727
NP_001182728
NP_001182729
NP_001182732

NP_001239587
NP_001239588
NP_034830

Localisation (UCSC)Chr 19: 11.09 – 11.13 MbChr 9: 21.63 – 21.66 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le LDLR ou récepteur des LDL est une protéine dont le gène est le LDLR situé sur le chromosome 19 humain[5]. Les travaux de Joseph Goldstein et de Michael Brown sur ce récepteur leur ont valu le prix Nobel de physiologie ou médecine en 1985.

Structure et rôles

Il s'agit d'une glycoprotéine faisant 164 Kdaltons[6].

Le PCSK9 favorise la dégradation de cette protéine, entraînant un ralentissement de celle du LDL cholestérol et une augmentation du taux sanguin de ce dernier[7].

En médecine

Différentes mutations du gène provoquent une hypercholestérolémie familiale[8]. Près de 1200 variants ont été identifiés, dont 80 % ayant des conséquences sur le taux de cholestérol[9].

Les médicaments de type anti-PCSK9 augmentent le taux de LDLR, favorisant la dégradation du LDL cholestérol et abaissant le taux sanguin de ces derniers.

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000130164 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032193 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Lindgren V, Luskey KL, Russell DW, Francke U, Human genes involved in cholesterol metabolism: chromosomal mapping of the loci for the low density lipoprotein receptor and 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase with cDNA probes, Proc Natl Acad Sci U S A, 1985;82:8567–8571
  6. Schneider WJ, Beisiegel U, Goldstein JL, Brown MS, Purification of the low density lipoprotein receptor, an acidic glycoprotein of 164,000 molecular weight, J Biol Chem, 1982;257:2664–2673
  7. Maxwell KN, Breslow JL, « Adenoviral-mediated expression of Pcsk9 in mice results in a low-density lipoprotein receptor knockout phenotype », Proc Natl Acad Sci U S A, 2004;101:7100-7105
  8. Hobbs HH, Brown MS, Goldstein JL, Molecular genetics of the LDL receptor gene in familial hypercholesterolemia, Hum Mutat, 1992;1:445–466
  9. Usifo E, Leigh SE, Whittall RA et al. Low-density lipoprotein receptor gene familial hypercholesterolemia variant database: update and pathological assessment, Ann Hum Genet, 2012;76:387–401
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