HERC2

HERC2
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2KEO, 3KCI, 4L1M

Identifiants
AliasesHERC2, D15F37S1, SHEP1, jdf2, p528
IDs externesOMIM: 605837 MGI: 103234 HomoloGene: 3430 GeneCards: HERC2
Position du gène (Homme)
Chromosome 15 humain
Chr.Chromosome 15 humain[1]
Chromosome 15 humain
Localisation génomique pour HERC2
Localisation génomique pour HERC2
Locus15q13.1Début28,111,040 bp[1]
Fin28,322,179 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 7 (souris)
Chr.Chromosome 7 (souris)[2]
Chromosome 7 (souris)
Localisation génomique pour HERC2
Localisation génomique pour HERC2
Locus7 B5|7 33.42 cMDébut55,699,944 bp[2]
Fin55,881,548 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • nerf sural

  • hypophyse

  • corps calleux

  • anté-hypophyse

  • gyrus frontal supérieur

  • cortex préfrontal

  • Brodmann area 9

  • skeletal muscle tissue

  • muscle gastrocnémien

  • noyau accumbens
Fortement exprimé dans
  • secondary oocyte

  • gyrus frontal supérieur

  • medial dorsal nucleus

  • Aire tegmentale ventrale

  • cerebellar cortex

  • noyau vestibulaire médian

  • Subiculum

  • substantia nigra

  • noyau paraventriculaire de l'hypothalamus

  • pontine nuclei
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • guanyl-nucleotide exchange factor activity
  • zinc ion binding
  • liaison ion métal
  • SUMO binding
  • ubiquitin-protein transferase activity
  • liaison protéique
  • ubiquitin protein ligase binding
  • activité de transférase
  • ubiquitin protein ligase activity
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • membrane
  • nucléoplasme
  • membrane mitochondriale interne
  • centriole
  • cytosquelette
  • noyau
Processus biologique
  • cellular response to DNA damage stimulus
  • Ubiquitination
  • spermatogenèse
  • intracellular protein transport
  • double-strand break repair via nonhomologous end joining
  • réparation de l'ADN
  • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
  • regulation of molecular function
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

8924

15204

Ensembl

ENSG00000128731
ENSG00000276802
ENSG00000277278

ENSMUSG00000030451

UniProt

O95714

Q4U2R1

RefSeq (mRNA)

NM_004667

NM_010418
NM_001360080

RefSeq (protéine)

NP_004658

NP_034548
NP_001347009

Localisation (UCSC)Chr 15: 28.11 – 28.32 MbChr 7: 55.7 – 55.88 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

HERC2 est une enzyme de type ubiquitine ligase E3. Son gène est HERC2 est situé sur le chromosome 15 humain[5].

Le gène HERC2, en combinaison avec le gène OCA2, affecte la couleur de l'iris humain: trois haplotypes dans la région OCA2-HERC2 associés aux yeux bleus ont ainsi été identifiés[6], et sont tous le plus fréquemment rencontrés en Europe du Nord et en Europe occidentale. Deux de ces haplotypes sont les plus fréquemment retrouvés en Europe du Nord et en Europe occidentale, puis dans les Amériques, puis en Asie centrale et orientale. Le troisième est principalement retrouvé en Europe[6].

Articles connexes

Notes et références

  1. a b et c ENSG00000276802, ENSG00000277278 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128731, ENSG00000276802, ENSG00000277278 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030451 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. (en) Susana Sánchez-Tena, Monica Cubillos-Rojas, Taiane Schneider et Jose Luis Rosa, « Functional and pathological relevance of HERC family proteins: a decade later », Cellular and Molecular Life Sciences, vol. 73, no 10,‎ , p. 1955–1968 (ISSN 1420-682X et 1420-9071, DOI 10.1007/s00018-016-2139-8, lire en ligne, consulté le )
  6. a et b (en) Michael P. Donnelly, Peristera Paschou, Elena Grigorenko et David Gurwitz, « A global view of the OCA2-HERC2 region and pigmentation », Human Genetics, vol. 131, no 5,‎ , p. 683–696 (ISSN 0340-6717 et 1432-1203, PMID 22065085, PMCID PMC3325407, DOI 10.1007/s00439-011-1110-x, lire en ligne, consulté le )
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