La saison 2006 du Championnat du Tadjikistan de football est la 15e édition de la première division au Tadjikistan. La compétition regroupe douze clubs, qui s'affrontent deux fois, à domicile et à l'extérieur. En fin de saison, le dernier du classement est relégué et remplacé par le champion de deuxième division.
C'est le club de Regar-TadAZ Tursunzoda qui remporte la compétition cette saison après avoir terminé en tête du classement final, avec un seul point d'avance sur Hima Douchanbé et huit sur un duo composé du tenant du titre, Vakhsh Qurghonteppa et de Parvoz Bobojon Ghafurov. C'est le cinquième titre de champion du Tadjikistan de l'histoire du club, qui réalise même le doublé en battant Hima Douchanbé en finale de la Coupe du Tadjikistan.