CXCL12

CXCL12
Structure de la protéine CXCL12. Basé sur l'identifiant PDB 1a15.
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

1A15, 1QG7, 1SDF, 1VMC, 2J7Z, 2K01, 2K03, 2K04, 2K05, 2KEC, 2KED, 2KEE, 2KOL, 2NWG, 2SDF, 3GV3, 3HP3, 4LMQ, 4UAI, 2N55

Identifiants
AliasesCXCL12
IDs externesOMIM: 600835 MGI: 103556 HomoloGene: 128606 GeneCards: CXCL12
Position du gène (Homme)
Chromosome 10 humain
Chr.Chromosome 10 humain[1]
Chromosome 10 humain
Localisation génomique pour CXCL12
Localisation génomique pour CXCL12
Locus10q11.21Début44,370,165 bp[1]
Fin44,386,493 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 6 (souris)
Chr.Chromosome 6 (souris)[2]
Chromosome 6 (souris)
Localisation génomique pour CXCL12
Localisation génomique pour CXCL12
Locus6 54.81 cM|6 F1Début117,145,496 bp[2]
Fin117,158,328 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • jointure synoviale

  • péricarde

  • canal galactophore

  • os spongieux

  • parietal pleura

  • membrane synoviale

  • artère temporale superficielle

  • vésicule biliaire

  • veine cave

  • mamelon
Fortement exprimé dans
  • canal déférent

  • artère carotide interne

  • rate

  • cheville

  • articulation talo-crurale

  • artère carotide externe

  • thymus

  • lèvre

  • corpuscule carotidien

  • corps du fémur
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • chemokine receptor binding
  • cytokine activity
  • chemokine activity
  • CXCR chemokine receptor binding
  • chemoattractant activity
  • growth factor activity
  • signaling receptor binding
  • integrin binding
  • liaison protéique
Composant cellulaire
  • membrane plasmique
  • région extracellulaire
  • exosome
  • external side of plasma membrane
  • milieu extracellulaire
  • cytoplasme
  • noyau
  • collagen-containing extracellular matrix
Processus biologique
  • negative regulation of leukocyte tethering or rolling
  • G protein-coupled receptor signaling pathway
  • regulation of calcium ion transport
  • response to hypoxia
  • positive regulation of endothelial cell proliferation
  • positive regulation of cell migration
  • chemokine-mediated signaling pathway
  • adult locomotory behavior
  • response to mechanical stimulus
  • response to peptide hormone
  • positive regulation of monocyte chemotaxis
  • cellular calcium ion homeostasis
  • response to virus
  • migration d'un neurone
  • response to heat
  • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
  • positive regulation of axon extension involved in axon guidance
  • circulation sanguine
  • telencephalon cell migration
  • chimiotaxie
  • regulation of actin polymerization or depolymerization
  • positive regulation of calcium ion import
  • développement cérébral
  • adhésion cellulaire
  • positive regulation of dopamine secretion
  • animal organ regeneration
  • positive regulation of neuron differentiation
  • réponse immunitaire
  • positive regulation of cell population proliferation
  • cell chemotaxis
  • negative regulation of leukocyte apoptotic process
  • response to radiation
  • positive regulation of T cell migration
  • positive regulation of cell adhesion
  • transduction de signal
  • positive chemotaxis
  • induction of positive chemotaxis
  • réponse de défense
  • response to ultrasound
  • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide
  • T cell chemotaxis
  • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain
  • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain
  • regulation of signaling receptor activity
  • Guidage axonal
  • viral process
  • integrin activation
  • chemokine (C-X-C motif) ligand 12 signaling pathway
  • cellular response to chemokine
  • negative regulation of dendritic cell apoptotic process
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

6387

20315

Ensembl

ENSG00000107562

ENSMUSG00000061353

UniProt

P48061

P40224

RefSeq (mRNA)

NM_199168
NM_000609
NM_001033886
NM_001178134
NM_001277990

NM_001012477
NM_013655
NM_021704

RefSeq (protéine)

NP_000600
NP_001029058
NP_001171605
NP_001264919
NP_954637

NP_001012495
NP_038683
NP_068350

Localisation (UCSC)Chr 10: 44.37 – 44.39 MbChr 6: 117.15 – 117.16 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le CXCL12, appelée également stromal cell-derived factor 1 (SDF-1), est une protéine chimiokine de type CXC.

Rôles

Ses récepteurs sont le CXCR4 et le CXCR7[5].

Il intervient dans les interactions cellulaires dans le système immunitaire.

Il joue un rôle dans la migration cellulaire dans le système nerveux central en cours de développement[5]. Il protège ainsi les nouveaux neurones contre l'apoptose en stimulant l'expression de la protéine Rb[6] et en inhibant le récepteur de la NMDA (acide N-méthyl-D-aspartique)[7]. Sa propre expression est augmenté en cas d'accident vasculaire cérébral au niveau de la partie ischémiée du cerveau, contribuant à la migration de cellules progénitrices à ce niveau[8]. Il permet, par ailleurs, de moduler la neurotransmission et les interactions avec les cellules gliales[9].

La chaîne lourde de la ferritine interagit cependant avec le CXCR4, ce qui altère le signal induit par le CXCL12[10] et serait l'un des mécanismes suspecté de l'atteinte des fonctions supérieures lors du SIDA[11].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000107562 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000061353 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. a et b Tiveron MC, Cremer H, CXCL12/CXCR4 signalling in neuronal cell migration, Curr Opin Neurobiol, 2008;18:237–244
  6. Khan MZ, Brandimarti R, Shimizu S, Nicolai J, Crowe E, Meucci O, The chemokine CXCL12 promotes survival of postmitotic neurons by regulating Rb protein, Cell Death Differ, 2008;15:1663–1672
  7. Nicolai J, Burbassi S, Rubin J, Meucci O, CXCL12 inhibits expression of the NMDA receptor’s NR2B subunit through a histone deacetylase-dependent pathway contributing to neuronal survival, Cell Death Dis, 2010;1:e33
  8. Robin AM, Zhang ZG, Wang L et al. Stromal cell-derived factor 1alpha mediates neural progenitor cell motility after focal cerebral ischemia, J Cereb Blood Flow Metab, 2006;26:125–134
  9. Li M, Ransohoff RM, Multiple roles of chemokine CXCL12 in the central nervous system: a migration from immunology to neurobiology, Prog Neurobiol, 2008;84:116–131
  10. Li R, Luo C, Mines M, Zhang J, Fan GH, Chemokine CXCL12 induces binding of ferritin heavy chain to the chemokine receptor CXCR4, alters CXCR4 signaling, and induces phosphorylation and nuclear translocation of ferritin heavy chain, J Biol Chem, 2006;281:37616–37627
  11. Pitcher J, Abt A, Myers J et al. Neuronal ferritin heavy chain and drug abuse affect HIV-associated cognitive dysfunction, J Clin Investig, 2014
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